High-coverage paleo-genome research identifies a pathogenic mutation on EXT1 in a Qing-period Chinese individual with multiple osteochondromas

الورم العظمي الغضروفي المتعدد (MO) هو مرض عظمي نادر ذو مظاهر متغيرة تجعل من الصعب تمييزه عن الأمراض المشابهة ظاهرياً، سواء من الناحية المورفولوجية أو الإشعاعية. باعتباره اضطراباً أحادياً مرتبطاً بطفرات في EXT1 أو EXT2، يمكن أن يوفر تحليل الحمض النووي القديم تشخيصات مؤكدة وراثياً ورؤى حول التسبب في الحالات المشتبه بها. لمواصلة التحقيق في حالة مشتبه بها سابقاً لورم عظمي غضروفي متعدد من شاندونغ في عهد أسرة تشينغ بالصين، أنتجنا بيانات تسلسل الإكسوم الكامل القديم من العظم الصخري للفرد، مما أسفر عن متوسط تغطية تسلسل قدره 27.172×. حددنا طفرة مرضية متغايرة الزيجوت في موقع ارتباط الليغاند في المجال الفرعي Rossmann-2 من EXT1 (c.791T > C؛ p.Leu264Pro) بعمق تسلسل قدره 17×، وهي طفرة وُجدت أيضاً في مريض حديث من أمريكا اللاتينية غير ذي صلة. بالإضافة إلى ذلك، من خلال التنبؤ بالبنية ثلاثية الأبعاد لبروتين EXT1 وتحليلها، اكتشفنا تلفاً بنيوياً ووظيفياً. توسع نتائجنا الطيف المعروف لطفرات EXT1 وتعزز الخريطة الشاملة للطراز الجيني-الظاهري للورم العظمي الغضروفي المتعدد النادر، مما يوفر رؤى حول علم الأمراض الوراثي من منظور تاريخي. علاوة على ذلك، يوسع هذا البحث فهم المشهد المرضي في شمال الصين، سواء من الناحية الباليوباثولوجية أو الباليوجينية.