Yersinia pestis strains from Latvia show depletion of the pla virulence gene at the end of the second plague pandemic

دراسات الجينوم القديمة حددت يرسينيا بيستيس (Y. pestis) كعامل مسبب للجائحة الثانية للطاعون (القرن الرابع عشر إلى الثامن عشر) التي بدأت بالموت الأسود (1347–1353). معظم سلالات Y. pestis التي تم فحصها من هذه الجائحة تم عزلها من أوروبا الغربية، ولا يُعرف الكثير عن تنوع وتطور هذا البكتيريا الدقيق في دول أوروبا الشرقية. في هذه الدراسة، فحصنا بقايا بشرية تم استخراجها من مقبرتين في ريغا (لاتفيا). تشير الأدلة التاريخية إلى أن الدفن كان نتيجة لتفشي الطاعون خلال القرن السابع عشر. تم استخراج الحمض النووي من أسنان 16 فردًا وإخضاعه لتسلسل البندقية. كشف تحليل البيانات الميتاجينومية عن وجود تسلسلات Y. pestis في أربع بقايا، مما يؤكد أن الأفراد المدفونين كانوا ضحايا للطاعون. في عينتين، كانت تغطية الحمض النووي لـ Y. pestis كافية لإعادة بناء الجينوم. أظهر التحليل التطوري اللاحق أن سلالات ريغا وقعت ضمن تنوع الجينومات المعروفة بعد الموت الأسود. ومن المثير للاهتمام أن العزلتين اللاتفيتين لم تتجمعا معًا. علاوة على ذلك، اكتشفنا انخفاضًا في تغطية منطقة بلازميد pPCP1 التي تحتوي على جين pla. أشار التحليل الإضافي إلى وجود بلازميدين pPCP1، أحدهما مع منطقة جين pla والآخر بدونها، وكروموسوم بكتيري واحد فقط، مما يشير إلى أن نفس البكتيريا حملت بلازميدين pPCP1 متميزين. بالإضافة إلى ذلك، وجدنا نفس النمط في غالبية سلالات ما بعد الموت الأسود المنشورة سابقًا، ولكن ليس في سلالات الموت الأسود. جين pla هو عامل ضراوة مهم للعدوى والانتقال في البشر. وبالتالي، فإن انتشار السلالات المستنفدة لـ pla قد يكون، من بين أسباب أخرى، قد ساهم في اختفاء الجائحة الثانية للطاعون في أوروبا في القرن الثامن عشر.