祖源树 سجل دخولك عينة علمية عينات الرفات أوراق الحمض النووي

A reference quality, fully annotated diploid genome from a Saudi individual

جينوم ثنائي الصيغة الصبغية بجودة مرجعية ومُعلَّق بالكامل من فرد سعودي
PRJNA891101 الورقة الأصلية / DOI2024-11-231 عينة (الدراسة)

تفسير الذكاء الاصطناعيمولّد بالذكاء الاصطناعي

أول جينوم سعودي كامل من طرف إلى طرف، متاح مجاناً للجميع.

قام فريق من الباحثين بتسلسل جينوم متطوع سعودي باستخدام طرق متعددة، ثم أنتجوا تجميعاً جديداً من الصفر لجميع الكروموسومات ما عدا الكروموسوم Y، وأطلقوا عليه اسم KSA001. نقلوا التعليقات الجينية من الجينوم المرجعي لإكمال التوصيف، ونشروا البيانات والتجميع والتعليقات مجاناً وفق مبادئ FAIR. هذا أول جينوم سعودي بتجميع كامل من طرف إلى طرف، مما يجعله مرجعاً مهماً لسكان شبه الجزيرة العربية.

تفسير العينات

يحتوي موقعنا على عينة واحدة فقط من هذا الجينوم، وهي عينة سعودية. لم يتم تحديد السلالة الأبوية (Y) في هذه العينة، بينما تم تحديد السلالة الأمومية M30-C16234T. لا توجد بيانات ثقافية أو مواقع مرتبطة. هذا يعني أن العينة تمثل فرداً سعودياً واحداً، وقد تكون السلالة الأمومية M30 شائعة في المنطقة، لكن لا يمكن تعميم النتائج على جميع السعوديين.

لعشاق علم الأنساب

يفيد عشاق علم الأنساب لأنه يوفر مرجعاً جينومياً عالي الجودة من السعودية، مما يساعد في تحسين تحليل السلالات والتنوع الجيني في شبه الجزيرة العربية، ويدعم الدراسات المستقبلية للأنساب المحلية.

الملخص

استخدمنا طرق تسلسل متعددة لتسلسل جينوم متطوع من المملكة العربية السعودية. استخدمنا البيانات الناتجة لإنشاء تجميع de novo للجينوم، واستخدمنا طرق حسابية مختلفة لتحسين التجميع. ونتيجة لذلك، قدمنا تجميعًا متصلًا لجينوم كامل لجميع الكروموسومات (باستثناء الكروموسوم Y) لفرد من المملكة العربية السعودية، وسمّينا هذا التجميع KSA001. قمنا بنقل تعليقات الجينوم من الجينوم المرجعي لتعليق KSA001 بشكل كامل، وقمنا بإتاحة جميع بيانات التسلسل الرئيسية والتجميع وتعليقات الجينوم مجانًا في قواعد البيانات العامة باستخدام مبادئ بيانات FAIR. KSA001 هو أول جينوم مُجمَّع من الطرف إلى الطرف من فرد سعودي، وهو متاح مجانًا لأي غرض.

العينات والبيانات على TheYtree

1عينات في الموقع
0تم تحديد السلالة Y

السلالات الأمومية (mtDNA)