Interpretación por IAGenerado por IA
¿Se puede recuperar ADN humano antiguo del sedimento de yacimientos al aire libre?
Este estudio analizó sedimentos de dos yacimientos arqueológicos al aire libre: Katsuren (Okinawa, siglos XII-XIII) y Oshima 2 (Hokkaido, siglos XI-XII). Se extrajo ADN de cinco muestras en Katsuren y once en Oshima 2, combinando secuenciación masiva y captura dirigida del ADN mitocondrial humano. El objetivo era comprobar si es factible determinar haplogrupos mitocondriales a partir de sedimentos en contextos abiertos, donde el ADN suele degradarse más.
- Se recuperó ADN mitocondrial humano de sedimentos en dos yacimientos arqueológicos al aire libre.
- Se identificaron los haplogrupos mitocondriales M7a1b1, D4j y D4a1 en las muestras analizadas.
- La captura dirigida del ADN mitocondrial permitió obtener suficientes lecturas para asignar haplogrupos en algunos sedimentos.
Interpretación de muestras
En total se procesaron 16 muestras de sedimento: 5 de Katsuren (Okinawa) y 11 de Oshima 2 (Hokkaido). En Katsuren, dos individuos enterrados bajo la muralla del castillo aportaron muestras de sedimento del interior del cráneo, alrededor de caderas y costillas, y del exterior del pozo. También se tomó una costilla de cada individuo para comparar. En Oshima 2, las 11 muestras provienen de distintos contextos del yacimiento. Los haplogrupos mitocondriales detectados fueron M7a1b1 (2 muestras), D4j (1) y D4a1 (1).
Para aficionados a la genealogía
Para los aficionados a la genealogía, esto sugiere que los sedimentos de yacimientos al aire libre pueden ser una fuente alternativa de ADN mitocondrial cuando no hay huesos disponibles, aunque la degradación limita los resultados. Los haplogrupos M7a1b1, D4j y D4a1 conectan con linajes de Asia Oriental y Japón.
Resumen
Se recolectaron cinco muestras de sedimento en un sitio de enterramiento, el castillo de Katsuren, ubicado en Okinawa, que data de mediados del siglo XII a principios del XIII durante el período Gusuku (Figura 1). Aquí, se encontraron dos enterramientos con restos esqueléticos bajo la muralla del castillo. Se recolectó una muestra de sedimento del interior del cráneo del Pozo 138. Del Pozo 178, se obtuvieron cuatro muestras de sedimento: una del interior del cráneo, una de sedimento alrededor de los huesos de la cadera, una de sedimento alrededor de los huesos de las costillas y una de un área fuera del pozo (Figura 1, Tabla S1). Además, se recolectó un hueso de costilla de cada individuo para comparar con los resultados obtenidos de los sedimentos. El segundo sitio es un sitio de vivienda conocido como Oshima 2, que data de los siglos XI a XII durante el período Satsumon y está ubicado en Hokkaido (Figura 1). Recolectamos once muestras de sedimento de diferentes contextos dentro del sitio (Figura S1, Tabla S2). Se extrajo ADN de todas las muestras y se secuenció utilizando las plataformas Illumina NovaSeq e iSeq (ver Métodos). Realizamos una combinación de secuenciación shotgun (entre 12447839 y 85971229 número de lecturas) y enriquecimiento por captura dirigida para ADNmt humano (entre 70064 y 2174014 número de lecturas) para investigar la viabilidad de determinar haplogrupos de ADNmt humano a partir de muestras de sedimento en sitios arqueológicos al aire libre.