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Genetic Evidence of Yersinia pestis from the First Pandemic

Preuves génétiques de Yersinia pestis issues de la première pandémie
PRJNA1303691 Article original / DOI2025-07-3112 échantillons (étude)

Interprétation par IAGénéré par IA

Première preuve génomique de la peste à Jérash, près du foyer de la pandémie.

Des archéologues ont analysé un charnier du VIe-VIIe siècle à Jérash, en Jordanie. Grâce à l'ADN ancien, ils ont identifié Yersinia pestis chez cinq individus. Les génomes sont presque identiques et se rattachent aux lignées de la première pandémie. C'est la première fois que la bactérie est détectée dans l'est de la Méditerranée, région d'origine historique de la peste de Justinien.

Interprétation des échantillons

Le site de Jérash a livré 12 échantillons, dont 11 avec un haplogroupe Y résolu. Tous appartiennent à la macro-haplogroupe R, avec des sous-clades comme R-L754, R-M269 et R-S8183. Aucune donnée mitochondriale exploitable n'est disponible. Ces résultats proviennent d'un petit nombre d'individus et ne représentent pas toute la population locale.

Pour les passionnés de généalogie

Pour les passionnés de généalogie génétique, cette étude montre comment l'ADN ancien relie les lignées paternelles à des événements historiques. Elle confirme la présence de la peste dans une région clé, mais les haplogroupes Y observés restent limités et ne doivent pas être généralisés.

Résumé

La peste de Justinien a marqué le début de la Première Pandémie (541–750 de notre ère), mais aucune preuve génomique de Yersinia pestis n’avait jusqu’à présent été retrouvée en Méditerranée orientale, où l’épidémie a été initialement documentée. Cette étude visait à déterminer si Y. pestis était présente dans une fosse commune du milieu du VIe au début du VIIe siècle à Jerash, en Jordanie, et à caractériser son génome dans le contexte plus large des souches de la Première Pandémie. Méthodes : Nous avons analysé des échantillons provenant de plusieurs individus retrouvés dans la fosse commune de Jerash. Un criblage initial pour la présence potentielle d’agents pathogènes a été réalisé par protéomique. Des échantillons sélectionnés ont été soumis à une extraction d’ADN ancien et à un séquençage du génome entier. Des analyses génomiques comparatives et phylogénétiques ont été menées pour évaluer l’identité des souches et leur position évolutive. Résultats : Le séquençage génomique a permis de récupérer de l’ADN de Y. pestis chez cinq individus, révélant des génomes hautement similaires. Toutes les souches se regroupaient étroitement avec d’autres lignées de la Première Pandémie, mais étaient remarquablement retrouvées pour la première fois dans une région géographiquement proche de l’épicentre historique de la pandémie. Les génomes quasi identiques chez divers individus suggèrent une épidémie due à une seule lignée circulante au moment de cette flambée. Conclusions : Cette étude fournit la première preuve génomique de Y. pestis en Méditerranée orientale pendant la Première Pandémie, reliant les découvertes archéologiques à la génomique des agents pathogènes près du point d’origine de la peste de Justinien. Phrase de résumé : Des preuves génomiques relient Y. pestis à la Première Pandémie dans une cité antique.

Échantillons et données sur TheYtree

12échantillons sur le site
11haplogroupe Y déterminé

Haplogroupes paternels (Y-ADN)

HaplogroupeÉchantillons
R-L754 2
R 2
R-FGC46209 1
R-S8183 1
R-M269 1
R-P297 1
R-L2 1
R-FGC46820 1
R1 1

Haplogroupes maternels (ADNmt)

Échantillons marquants Autres échantillons →

ÉchantillonY-DNAmtDNACulture / Période
N1_S1 R-P297 — · early 7th century
N2_S2 R-S8183 — · early 7th century
N3_S3 R — · early 7th century
N4_S4 R — · early 7th century
N6_S2 R1 — · early 7th century
N7_S3 R-L754 — · early 7th century
N8_S4 R-FGC46820 — · early 7th century
Sample_1 R-L2 — · early 7th century
Sample_2 R-L754 — · early 7th century
Sample_3 R-M269 — · early 7th century