Interpretazione IAGenerato da IA
Peste nera: a Riga ceppi con gene pla ridotto spiegano la fine della pandemia.
Gli scienziati hanno analizzato i resti di 16 persone sepolte a Riga (Lettonia) nel XVII secolo, trovate in due cimiteri legati a epidemie di peste. Quattro individui erano vittime della peste: il loro DNA conteneva tracce del batterio Yersinia pestis. Per due di loro è stato possibile ricostruire l'intero genoma. I ceppi di Riga mostrano che il batterio aveva già perso parte del gene pla, importante per la virulenza. Questo indebolimento potrebbe aver contribuito alla scomparsa della seconda pandemia in Europa nel Settecento.
- Quattro resti su 16 contenevano DNA di Yersinia pestis, confermando vittime della peste del XVII secolo.
- I due genomi completi di Riga non sono imparentati tra loro, suggerendo diversità locale del batterio.
- In molti ceppi post-Black Death manca parte del gene pla, assente invece nei ceppi della Morte Nera.
Interpretazione dei campioni
Dei 16 individui studiati, 5 hanno aplotipi Y risolti: N-Y15922 (2), T-L446, R-L51 e R-L23. I lignaggi mitocondriali più comuni sono U5b1b1f e U5a2a1 (2 ciascuno), seguiti da H24b, H11b1, H11a1 e U5a1b1h. Questi dati mostrano una popolazione eterogenea, con aplogruppi tipici dell'Europa nord-orientale e centrale, coerenti con la posizione di Riga come crocevia commerciale.
Per gli appassionati di genealogia
Per chi studia le origini, questo lavoro mostra che le pandemie storiche hanno lasciato tracce genetiche nei batteri, non negli uomini. I ceppi indeboliti di Yersinia pestis potrebbero aver favorito la fine dell'epidemia, un esempio di come l'evoluzione dei patogeni influenzi la storia umana.
Riassunto
Gli studi genomici antichi hanno identificato Yersinia pestis (Y. pestis) come l'agente causale della seconda pandemia di peste (XIV–XVIII secolo) iniziata con la Peste Nera (1.347–1.353). La maggior parte dei ceppi di Y. pestis studiati relativi a questa pandemia è stata isolata dall'Europa occidentale, e non molto è noto sulla diversità e sulla microevoluzione di questo batterio nei paesi dell'Europa orientale. In questo studio, abbiamo analizzato resti umani scavati in due cimiteri a Riga (Lettonia). Le evidenze storiche suggeriscono che le sepolture furono una conseguenza di epidemie di peste durante il XVII secolo. Il DNA è stato estratto dai denti di 16 individui e sottoposto a sequenziamento shotgun. L'analisi dei dati metagenomici ha rivelato la presenza di sequenze di Y. pestis in quattro resti, confermando che gli individui sepolti erano vittime della peste. In due campioni, la copertura del DNA di Y. pestis è stata sufficiente per la ricostruzione del genoma. La successiva analisi filogenetica ha mostrato che i ceppi di Riga rientravano nella diversità dei genomi già noti del periodo post-Peste Nera. È interessante notare che i due isolati lettoni non si raggruppavano insieme. Inoltre, abbiamo rilevato un calo di copertura della regione del plasmide pPCP1 contenente il gene pla. Ulteriori analisi hanno indicato la presenza di due plasmidi pPCP1, uno con e uno senza la regione del gene pla, e un solo cromosoma batterico, indicando che lo stesso batterio portava due plasmidi pPCP1 distinti. Inoltre, abbiamo trovato lo stesso pattern nella maggior parte dei ceppi post-Peste Nera precedentemente pubblicati, ma non nei ceppi della Peste Nera. Il gene pla è un importante fattore di virulenza per l'infezione e la trasmissione negli esseri umani. Pertanto, la diffusione di ceppi impoveriti di pla può, tra le altre cause, aver contribuito alla scomparsa della seconda pandemia di peste nell'Europa del XVIII secolo.