Genomic insights into the ancestry and mortality of a historical era population from Southwest China

中国南西部の雲貴高原（雲南省と貴州省）は、長きにわたる民族言語的多様性によって特徴づけられ、それは複雑な人口史によって形成されてきた。近年、異なる語族に属する多数の集団がこの地域に居住してきたが、彼らの交流の性質と範囲は依然として十分に理解されていない。貴州省南部の多民族地域に位置する天然のカルスト洞窟において、考古学者は元朝末期から明朝初期（575～685 cal BP）に年代づけられる数十人の散在した骨格遺残を発見した。これらの個人の遺伝的起源と死亡の背景はこれまで不明であった。ここで我々は、洞窟から回収された22人の個人からのゲノムワイドな古代DNA分析を提示する。結果は、顕著に遺伝的に均質な集団を明らかにし、古代の北東アジアおよび南東アジアの祖先系統が混合していることを示すが、同時代の近隣集団とは明瞭な遺伝的分化を示している。この祖先プロファイルは、中国南西部の現在の民族言語集団に寄与した遺伝的構成要素を表している。遺伝的親族関係分析は、この集団が複数の家族単位から構成され、女性が優勢であったことを示唆している。さらに、我々は一人の個人において真正なSalmonella enterica（S. enterica）DNAを検出し、それは血清型S. CholeraesuisおよびS. Paratyphi Cの参照ゲノムとの高い配列類似性、および特徴的な古代DNA損傷パターンによって支持された。他の個人では同様の病原体DNAは同定されなかった。ゲノム証拠を歴史記録と統合することにより、我々はこれらの個人が広範な疫病ではなく、紛争に関連する集団的死亡を最も likely に表していると推論する。