Ancient genomes reveal early-stage admixture and genetic diversity in the Northwestern Kyushu Yayoi

日本列島の人口史は、大規模な移住と混血の主要な出来事によって形作られた。とりわけ、約3,000年前の縄文時代から弥生時代への移行は重要である。縄文時代は長く定着した狩猟採集の伝統であり、弥生時代にはユーラシア大陸からの移住者が農業と新しい技術をもたらした。しかし、大陸からの移住者と在来の縄文集団との混血の時期、程度、地域的変異については、いまだ十分に理解されていない。西北九州は特に注目されてきた。というのも、骨格分析がこの地域の弥生時代個体が縄文時代に似た形態的特徴を保持していることを示してきたからである。しかし、その遺伝的背景は不明のままである。ここで我々は、日本国長崎県から発掘された西北九州の弥生時代個体4体の全ゲノム配列を報告する。2体の個体はほぼ完全な縄文祖先を保持しており、混血していない縄文の子孫が、弥生時代前期から中期への過渡期まで、混血集団と並んで存続していたことを示している。他の2体の個体は混血の明確な証拠を示し、遺伝子解析は、移住者と在来の縄文集団との間の遺伝子流動がこの地域で既に約2.5～2.6千年前に始まっていたことを示唆した。これらの知見は、西北九州における混血が、弥生時代の開始時における単一の大規模移住事象によってではなく、徐々に起こったことを示唆しており、古代日本の遺伝的景観を形作った複雑な人口動態への新たな洞察を提供する。