祖源树 ログイン 科学的 古代人 DNA論文

High-Coverage Jomon Genomes Provide Insights into Population Structure and Genetic Traits of Ancient Japanese Hunter-Gatherers

高カバレッジ縄文ゲノムが古代日本人狩猟採集民の集団構造と遺伝的特徴に示す洞察
PRJDB39740 原著論文 / DOI2025-12-166 サンプル(研究)

AI解説AI生成

縄文ゲノム解析で現代日本人への貢献度が再評価され、古代適応の影響も明らかに。

この研究は、9000~2800年前の日本列島から得られた8つの高精度縄文ゲノムを分析しました。縄文人は時空間的に遺伝的均一性が高く、氷期後の孤立を反映していましたが、初期縄文の伊屋個体は最も初期の分岐を示し、現代日本人との親和性が低いことがわかりました。また、渡渡木・千鳥窪遺跡のゲノムから、本土日本人の縄文血統は約20%と推定され、従来の約13%より大幅に高いことが示されました。

サンプル解説

解析された8つの高カバレッジ縄文ゲノムのうち、サイト別ではDRR893171が3例、Y染色体はD-CTS4292、D-CTS220、D-Z1513が各1例、ミトコンドリアはN9bが2例、N9b3が1例でした。文化は初期縄文に属し、Y系統はすべてD系統で、現代日本人にも見られる系統です。

祖源愛好家にとっての意義

縄文血統が現代日本人に予想以上に貢献していることが示され、日本人の起源モデルが更新されます。また、古代の適応が現代の肥満や脂質異常症リスクに影響している可能性が示唆され、祖源愛好家にとって重要な知見です。

要約

我々は、日本列島全域にわたる9,000年前から2,800年前の8つの高カバレッジ縄文ゲノムを分析した。集団ゲノミクス解析により、後氷期の孤立を反映した時間的・空間的に実質的な遺伝的均一性が明らかになったが、時間的層別化が出現した。初期縄文(伊屋井)個体は最も初期の分岐を形成し、現代日本人との親和性がより弱かった。轟遺跡および千鳥窪遺跡のゲノムを用いて、我々は本土日本人における縄文祖先成分を約20%と推定した。これは従来の推定値(約13%)よりも大幅に高い。縄文ゲノムの直接解析に基づくポリジェニックスコア解析は、BMIおよび代謝形質スコアの上昇、免疫関連スコアの低下、心臓寸法の拡大を含む、その表現型素因に関する遺伝的証拠を提供し、これらのパターンは狩猟採集民の適応と一致していた。肥満および脂質異常症のリスク上昇を含むこれらの祖先的遺伝的影響は、現代日本人において持続している。我々の発見は、縄文集団が生態学的多様性にもかかわらず遺伝的連続性を維持していたことを示すとともに、現代日本人への予想を上回る寄与が集団史モデルを再形成し、古代の適応が現代の疾患感受性に影響を与え続けている仕組みを明らかにする。

TheYtree のサンプルとデータ

3サイト内サンプル
3Yハプログループ判明
1考古遺跡

サンプルマップ

地図タイル: TheYtree · 点の大きさ = サンプル数

父系(Y-DNA)ハプログループ

ハプログループサンプル
D-CTS220 1
D-Z1513 1
D-CTS4292 1

母系(mtDNA)ハプログループ

注目サンプル その他のサンプル →

サンプルY-DNAmtDNA文化 / 時期
Iyai4 D-CTS220 N9b3 Initial Jomon· 7341 ± 35 cal BP
Iyai15 D-CTS4292 N9b Initial Jomon· 7438 ± 23 cal BP
Iyai18 D-Z1513 N9b Initial Jomon· 7544 ± 26 cal BP