Lethal plague outbreaks in Lake Baikal hunter-gatherers 5,500 years ago

ペストは人類史上最も壊滅的な疾患の一つである1。しかし、ペストを引き起こす細菌Yersinia pestisの初期株は、約3,800年前まで腺ペスト型に必要な病原性因子を欠いていた2,3。その結果、初期のペスト株の罹患率と致死率は不明のままである。ここでは、約5,500年前に始まる、南東シベリアのバイカル湖近郊における完新世中期の狩猟採集民の間での2段階の集団発生に関連する初期のペスト株について記述する。これらの集団発生は4か所の狩猟採集民墓地にわたり認められ、ペスト感染の検出率は39%であった。親族関係の系譜を再構築することにより、小規模な家族集団が罹患したことを示し、これは人から人への感染と一致し、最初の集団発生は単一世代内で起こった。感染は急性の死亡、特に小児（8～11歳）において急性の死亡をもたらしたようである。さらに我々は、現在のYersinia pseudotuberculosisにも存在するypmスーパー抗原遺伝子座を含む機能的な差異に注目する。新たな株は既知のY. pestisに対して祖先的に分岐し、その出現の時期を制約し、これが約5,700年前より前に起こったことを示している。これらの知見は、ペストの集団発生がこれまで考えられていたよりも早く起こり、実際に致死的であったことを示している。我々は、新石器時代後期ヨーロッパの領域のはるか外側にある完新世中期の狩猟採集民共同体の間で集団発生が起こったことは、新石器時代の農業への移行期におけるより高い人口密度と生活様式の変化がペストの流行の前提条件であったという考えに異議を唱えるものであると主張する。