祖源树 ログイン 科学的 古代人 DNA論文

High incidence of AZF duplications in clan-structured Iranian populations detected through Y chromosome sequencing read depth analysis

Y染色体シーケンスリード深度解析により検出されたクラン構造を持つイラン人集団におけるAZF重複の高頻度
PRJEB61684 原著論文 / DOI2023-07-2287 サンプル(研究)

AI解説AI生成

イラン父系氏族集団でAZF重複が高頻度、最大8.0Mbの巨大重複も。

この研究は、イランの異なる民族集団に属する87人の男性のY染色体を次世代シーケンシングで解析し、AZFb/c領域の重複を調べたものです。その結果、イランでは千人ゲノム計画のデータセットと比べて重複頻度が2倍高いことがわかりました。特に父系氏族制の集団で重複が多く見られ、男性の有効集団サイズが小さいために負の選択が働きにくい可能性が示唆されています。また、AZFc遺伝子のコピー数を4倍にする8.0Mbの巨大重複も発見され、これはこの領域でこれまで報告された中で最大です。

サンプル解説

解析対象はイランの異なる民族集団に属する87人の男性で、全員のY染色体ハプログループが決定されています。上位ハプログループはT-TY491558(3人)、J-TY491551(2人)、N-Y37153(2人)、J-TY491553(2人)、J-Y83029(2人)などで、J系統が複数見られます。また、Q-Y148965、E-FT186773、E-A8612が各1人ずつ確認されています。これらの父系系統は、氏族制集団におけるAZF重複の高頻度と関連している可能性があります。

祖源愛好家にとっての意義

父系氏族制の集団では、AZF欠失だけでなく重複も男性不妊の原因として重要である可能性があります。自分のY染色体ハプログループが氏族制集団に属する場合、AZF領域の重複にも注意が必要です。

要約

ヒトY染色体のアンプリコニック領域は、非対立相同組換え(NAHR)を起こしうる大きな重複配列から構成されており、その結果として構造再編成が生じ、特に無精子症因子b/c(AZFb/c)領域で起こった場合には不妊の原因となりうる。AZF重複は、主に欠失に焦点を当てたSTSベースの研究の技術的限界のために長らく無視されてきたが、近年の次世代シーケンシング(NGS)技術により、生殖能力におけるその重要性を示す証拠が得られた。本研究では、NGSリードデプス法を用いて、異なる民族集団に属する87名のイラン人におけるAZFb/c再編成を検出した。イランにおける重複頻度は、「1000 Genomes」データセットの2倍であることが判明した。興味深いことに、ほとんどの重複は父系民族集団で見られ、これはおそらく、負の選択に対抗しうるより小さな男性有効集団サイズの結果であると考えられる。さらに、AZFc遺伝子のコピー数が4倍に増加する8.0 Mbの大きな重複を発見したが、これは我々の知る限り、この領域でこれまでに報告された中で最大の重複である。全体として、我々の結果は、男性不妊の原因を調査するためにはAZF欠失だけでなく重複も考慮することが重要であり、特に父系クラン基盤の集団においてそうであることを示唆している。

TheYtree のサンプルとデータ

87サイト内サンプル
87Yハプログループ判明

父系(Y-DNA)ハプログループ

ハプログループサンプル
T-TY491558 3
J-TY491553 2
J-Y83029 2
J-TY491551 2
N-Y37153 2
R-Y2568 1
N-B525 1
J-Y144533 1
J-Z41084 1
H-BY46699 1
L-Y16208 1
J-Y32707 1

注目サンプル その他のサンプル →

サンプルY-DNAmtDNA文化 / 時期
R083 J-TY491551 —
R013 R-Y65452 —
R068 R-SK2014 —
R018 R-FGC52936 —
R003 J-FT249691 —
R086 G-Z6764 —
R001 T-Y152024 —
R002 R-Z2110 —
R004 Q-FT387652 —
R005 J-Y144533 —