祖源树 ログイン 科学的 古代人 DNA論文

From bones to sediments: ancient human DNA from open-air archaeological sites

骨から堆積物へ:野外考古学遺跡からの古代ヒトDNA
PRJEB87497 原著論文 / DOI2026-03-024 サンプル(研究)

AI解説AI生成

骨から堆積物へ、露天遺跡の古代DNA研究の可能性を探る。

この研究は、沖縄の勝連城跡と北海道の大島2遺跡という露天考古遺跡から採取した堆積物サンプルを用いて、古代人のミトコンドリアDNAを分析できるか検証しました。骨のない場所でもDNAが残っている可能性に注目し、次世代シーケンサーで解析した結果、堆積物からも人骨と一致するミトコンドリアDNAハプログループが検出されました。これは、遺跡に骨が残っていなくても、堆積物から古代人の遺伝情報が得られる可能性を示しています。

サンプル解説

この研究では、沖縄の勝連城跡から5点、北海道の大島2遺跡から11点の堆積物サンプルが分析されました。勝連城跡では、2つの墓坑から頭骨内、骨盤周辺、肋骨周辺、墓坑外の土壌が採取され、同じ個体の肋骨も比較に使われました。大島2遺跡では住居内の異なる場所から11点が集められました。合計16点の堆積物からDNAが抽出され、骨がなくても遺伝情報が残る可能性が調べられました。

祖源愛好家にとっての意義

遺骨が残っていない遺跡でも、堆積物から古代人のミトコンドリアDNAが得られる可能性が示されました。これにより、これまで遺伝情報が得られなかった遺跡や地域の祖源研究が進むかもしれません。特に日本列島の古代集団の移動や交流を探る新たな手がかりになるでしょう。

要約

沖縄に位置するグスク時代、12世紀中頃から13世紀初頭に年代づけられる埋葬遺跡、勝連城跡において、5点の堆積物試料を採取した(図1)。ここでは、城壁の下から骨格遺存体を伴う2基の埋葬が発見された。ピット138からは、頭蓋骨内部からの堆積物試料1点を採取した。ピット178からは、頭蓋骨内部からのもの1点、寛骨周囲の堆積物からのもの1点、肋骨周囲の堆積物からのもの1点、ピット外の領域からのもの1点の計4点の堆積物試料を得た(図1、表S1)。さらに、堆積物から得られた結果と比較するため、各個体から肋骨1点を採取した。第2の遺跡は、北海道に位置し、擦文時代の11世紀から12世紀に年代づけられる、大島2遺跡として知られる住居遺跡である(図1)。我々は、遺跡内の異なるコンテクストから11点の堆積物試料を採取した(図S1、表S2)。すべての試料からDNAを抽出し、Illumina NovaSeqおよびiSeqプラットフォームを用いてシーケンスを行った(方法を参照)。露天考古学遺跡の堆積物試料からヒトmtDNAハプログループを決定することの実現可能性を調査するため、我々はショットガンシーケンス(リード数12447839から85971229の間)とヒトmtDNAを対象としたターゲットキャプチャー濃縮(リード数70064から2174014の間)の組み合わせを実施した。

TheYtree のサンプルとデータ

4サイト内サンプル
0Yハプログループ判明

母系(mtDNA)ハプログループ