Genetic Evidence of Yersinia pestis from the First Pandemic

ユスティニアヌスの疫病は第一次パンデミック（西暦541～750年）の始まりを画したが、これまでに東地中海地域からペスト菌（Yersinia pestis）のゲノム証拠は回収されていなかった。この地域は、この疫病の発生が最初に記録された場所である。本研究は、ヨルダン・ジェラシュにある6世紀中頃から7世紀初頭の集団墓地においてペスト菌が存在したかどうかを明らかにし、第一次パンデミック株のより広い文脈の中でそのゲノムを特徴づけることを目的とした。方法：ジェラシュの集団墓地から回収された複数の個人の試料を分析した。潜在的な病原体の存在に対する初期スクリーニングはプロテオミクスを用いて実施した。選定した試料に対して古代DNA抽出および全ゲノムシーケンシングを行った。株の同一性および進化的位置づけを評価するために、比較ゲノム解析および系統解析を実施した。結果：ゲノムシーケンシングにより、5人の個人からペスト菌DNAが回収され、きわめて類似したゲノムが明らかになった。すべての株は他の第一次パンデミック系統と密接にクラスターを形成したが、パンデミックの歴史的中心地に地理的に近い地域から初めて回収された点が特筆される。多様な個人間でほぼ同一のゲノムが認められたことは、この集団発生の時期に単一の流行系統によるアウトブレイクが起きたことを示唆する。結論：本研究は、第一次パンデミック期の東地中海地域におけるペスト菌の最初のゲノム証拠を提供し、ユスティニアヌスの疫病の起源地点付近における考古学的知見と病原体ゲノミクスを結びつけるものである。要約文：ゲノム証拠は、古代都市における第一次パンデミックとペスト菌を結びつける。