Reconstructing the West-East Genetic Division in Indonesia Using Ancient Genomes

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印尼东西部遗传分化的两阶段形成：先有旧石器基底，后被南岛扩张重塑。

华莱士线把印尼分成西边和东边，两边人群的遗传差异从哪来？这项研究新测了两例西印尼晚期新石器古人基因组，结合已发表的19例岛屿东南亚古人数据，发现差异分两步形成：早在全新世早期，西部采集人群就接近和平文化人群，东部则接近巴布亚人群；后来南岛扩张、大陆基因流入西部、巴布亚人群回迁东部，又叠加并重塑了这道分界。

• 东西部遗传分化在全新世早期就已出现，并非南岛扩张后才产生
• 西部采集人群相关祖先更接近和平文化人群，东部则更接近巴布亚相关人群
• 新石器及后新石器时代的多波迁徙（南岛扩张、大陆基因流入西部、巴布亚回迁东部）强化并重塑了早期格局

样本解读

本次研究新增2例西印度尼西亚晚期新石器基因组，Y染色体均成功解析，分别为O-F3288和O-FT131196，母系线粒体两例均为Y2a1。O-F3288属于东亚南方常见的O系下游支系，与南岛语人群扩张密切相关；O-FT131196则是一个较少见的支系。两例母系Y2a1同属一次观察，提示该地点人群母系多样性有限。样本量虽小，却是西印尼古代基因组的重要补充。

对祖源爱好者的意义

对祖源爱好者来说，这说明印尼人群的东西差异不是单一事件造成，而是旧有区域差异叠加多次迁徙的结果。看南岛、和平文化、巴布亚相关成分时，要意识到它们是在已有基底上叠加的，不能简单归为一次扩张。