High-coverage paleo-genome research identifies a pathogenic mutation on EXT1 in a Qing-period Chinese individual with multiple osteochondromas

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清代山东一例骨软骨瘤患者，古DNA锁定EXT1致病突变。

多发性骨软骨瘤（MO）是一种罕见的遗传性骨病，通常由EXT1或EXT2基因突变引起。研究者从山东清代一例疑似患者的岩骨中提取古DNA，做了全外显子测序，平均深度达27倍。结果在EXT1基因上找到一个杂合致病突变，该突变也出现在一位无关的现代拉丁美洲患者身上。蛋白三维结构预测显示这个突变会损害蛋白功能。这是首次用古DNA为古代MO疑似病例提供基因确诊。

• 在清代山东一例疑似多发性骨软骨瘤患者的岩骨中，成功获取平均深度27.172×的古全外显子数据。
• 检出EXT1基因杂合致病突变c.791T>C（p.Leu264Pro），测序深度17×，位于配体结合位点Rossmann-2亚结构域。
• 该突变与一位无关的现代拉丁美洲患者相同，蛋白三维结构预测显示其造成结构和功能损伤。

样本解读

站内该遗址仅收录1例样本，Y染色体单倍群为O-TYT63912，线粒体单倍群为G1c。父系O-TYT63912属于东亚常见的O系下游分支，母系G1c也常见于现代东亚人群。由于样本量只有1例，这些单倍群信息只能作为该个体的身份标签，不能代表整个清代山东人群的遗传面貌。

对祖源爱好者的意义

对祖源爱好者来说，这项研究说明古DNA不仅能追溯人群迁徙，还能直接诊断古代个体的遗传病。它提醒我们，罕见致病突变可能跨越时空和人群分布，古人的健康史同样值得关注。