Yersinia pestis strains from Latvia show depletion of the pla virulence gene at the end of the second plague pandemic

AI 解读AI 生成

拉脱维亚17世纪鼠疫遗骸揭示pla毒力基因缺失或助推大流行终结。

这项研究从拉脱维亚里加两处墓地发掘的16具17世纪人类遗骸中提取DNA，确认4人死于鼠疫，并成功重建了2个鼠疫菌基因组。有趣的是，这两株菌亲缘关系并不近，说明当时存在多个菌株传入。更关键的是，它们都缺少pla毒力基因，而该基因对人际传播至关重要。研究者还发现，多数后黑死病时期的菌株都有同样缺失，但黑死病时期没有。这可能意味着pla缺失的菌株传播力减弱，从而帮助终结了第二次鼠疫大流行。

• 在16具遗骸中检出4例鼠疫耶尔森菌DNA，确认里加墓地埋葬的是17世纪鼠疫受害者。
• 成功重建的2株拉脱维亚菌株并未聚类在一起，表明当地鼠疫菌具有多样性。
• 这些菌株的pPCP1质粒上pla毒力基因区域覆盖度下降，且同时携带含与不含pla的两种质粒；该模式在多数后黑死病菌株中存在，黑死病菌株则没有。

样本解读

站内样本统计显示，这16具遗骸中仅5例能解析出Y染色体单倍群，包括N-Y15922（2例）、R-L23、T-L446和R-L51各1例；线粒体单倍群以U5a2a1和U5b1b1f各2例为主，另有H1b、R1b1、H5a1a和H1g1各1例。这些父系和母系类型均常见于现代欧洲人群，说明墓地人群的遗传背景具有欧洲本地特征，但样本量小，不宜过度解读。

对祖源爱好者的意义

对祖源爱好者而言，这项研究提醒我们：古DNA不仅能追溯人群迁徙，还能揭示病原体的演化。鼠疫菌毒力基因的丢失可能改变了历史进程，而拉脱维亚样本补充了东欧在第二次鼠疫大流行中的微生物多样性，值得关注。