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From bones to sediments: ancient human DNA from open-air archaeological sites

从骨骼到沉积物:来自露天考古遗址的古代人类DNA
PRJEB87497 原始论文 / DOI2026-03-024 样本(研究)

AI 解读AI 生成

露天遗址沉积物也能提取古人类DNA,冲绳与北海道样本给出线索。

这项研究从冲绳胜连城和北海道大岛2号两处露天遗址采集了沉积物与骨骼样本,尝试提取古人类线粒体DNA。研究者用鸟枪法测序和线粒体DNA靶向捕获两种方法,成功从沉积物中获取了人类线粒体DNA信息,并鉴定出单倍群。这说明即使没有完整骨骼,露天遗址的沉积物也可能保存古人类遗传痕迹,为研究古代人群提供了新途径。

样本解读

站内统计显示,该研究相关样本共4例,Y染色体单倍群均未解析出结果,可能因沉积物中Y染色体DNA保存较差或捕获效率低。线粒体单倍群方面,M7a1b1出现2例,D4j和D4a1各1例。这些单倍群常见于东亚人群,尤其M7a1b1在冲绳地区有分布,与遗址地理位置相符。样本量虽小,但为露天遗址沉积物DNA研究提供了直接数据。

对祖源爱好者的意义

对祖源爱好者而言,这项研究意味着未来或许能通过遗址沉积物而非仅靠骨骼来追溯古代人群的母系源流,尤其对骨骼保存不佳的露天遗址,沉积物DNA可能成为补充甚至替代样本,拓展祖源检测的取材范围。

摘要

我们在冲绳的胜连城墓地采集了五个沉积物样本。该墓地可追溯至12世纪中期至13世纪早期的具宿时代(图1)。在城堡墙下发现了两处含骨骼遗骸的墓葬。我们从138号墓坑中采集了一个颅骨内部的沉积物样本。从178号墓坑中采集了四个沉积物样本:一个来自颅骨内部,一个来自髋骨周围的沉积物,一个来自肋骨周围的沉积物,还有一个来自墓坑外的区域(图1,表S1)。此外,我们还从每位墓葬中采集了一根肋骨,以便与沉积物样本的结果进行比较。第二个研究地点是位于北海道的大岛2号居所,该居所可追溯至11世纪至12世纪的萨门时代(图1)。我们从该居所的不同区域采集了11个沉积物样本(图S1,表S2)。我们从所有样本中提取DNA,并使用Illumina NovaSeq和iSeq平台进行测序(见方法部分)。我们结合鸟枪法测序(读取数在12447839至85971229之间)和针对人类线粒体DNA的靶向捕获富集(读取数在70064至2174014之间),研究了从露天考古遗址沉积物样本中确定人类线粒体DNA单倍群的可行性。

TheYtree 上的样本与数据

4站内样本
0Y 单倍群已解析

母系(mtDNA)单倍群