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High incidence of AZF duplications in clan-structured Iranian populations detected through Y chromosome sequencing read depth analysis

Alta incidência de duplicações AZF em populações iranianas de estrutura clânica detectada por análise de profundidade de leitura de sequenciamento do cromossomo Y
PRJEB61684 Artigo original / DOI2023-07-2287 amostras (estudo)

Interpretação por IAGerado por IA

Duplicações AZF são duas vezes mais comuns em populações iranianas com estrutura de clã.

O cromossomo Y possui regiões repetidas que podem sofrer recombinação e gerar duplicações ou deleções, afetando a fertilidade masculina. Este estudo usou sequenciamento de nova geração para medir a profundidade de leitura na região AZFb/c de 87 iranianos de diferentes etnias. A frequência de duplicações foi o dobro da observada no projeto 1000 Genomes, e a maioria apareceu em grupos patrilineares. Isso sugere que clãs com menor tamanho efetivo populacional masculino acumulam mais duplicações, possivelmente por seleção negativa mais fraca.

Interpretação das amostras

Foram analisados 87 iranianos de diferentes grupos étnicos, todos com linhagem paterna resolvida. As linhagens mais frequentes incluíram T-TY491558 (3), J-TY491553 (2), J-Y83029 (2), J-TY491551 (2) e N-Y37153 (2), além de outras com um representante cada. A amostragem cobre principalmente linhagens do Oriente Médio e Ásia Central, mas não há dados de DNA mitocondrial nem de cultura associada.

Para entusiastas de genealogia

Para quem pesquisa ancestralidade, isso mostra que duplicações no Y podem ser comuns em populações patrilineares e não devem ser ignoradas. Ao interpretar testes de Y, vale considerar que variações estruturais, e não só mutações pontuais, podem influenciar a fertilidade e a história das linhagens.

Resumo

A região amplicônica do cromossomo Y humano é composta por grandes sequências duplicadas que podem sofrer recombinação homóloga não alélica (NAHR), resultando em rearranjos estruturais que podem causar infertilidade, especialmente quando ocorrem na região do fator de azoospermia b/c (AZFb/c). Embora as duplicações do AZF tenham sido negligenciadas por muito tempo devido às limitações técnicas dos estudos baseados em STS que se concentravam principalmente em deleções, as recentes tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS) forneceram evidências de sua importância na fertilidade. Neste estudo, uma abordagem de profundidade de leitura de NGS foi usada para detectar rearranjos do AZFb/c em 87 iranianos de diferentes grupos étnicos. A frequência de duplicação no Irã provou ser duas vezes maior do que no conjunto de dados "1000 Genomes". Curiosamente, a maioria das duplicações foi encontrada em grupos étnicos patrilineares, possivelmente como consequência de seu menor tamanho populacional efetivo masculino, que pode neutralizar a seleção negativa. Além disso, encontramos uma grande duplicação de 8,0 Mb, resultando em um aumento de quatro vezes no número de cópias dos genes AZFc, que, ao nosso conhecimento, é a maior duplicação já relatada nessa região. Em geral, nossos resultados sugerem que é importante considerar não apenas as deleções do AZF, mas também as duplicações, para investigar as causas da infertilidade masculina, especialmente em populações patrilineares baseadas em clãs.

Amostras e dados no TheYtree

87amostras no site
87haplogrupo Y resolvido

Haplogrupos paternos (Y-DNA)

HaplogrupoAmostras
T-TY491558 3
J-TY491553 2
J-Y83029 2
J-TY491551 2
N-Y37153 2
J-FT249691 1
G-GG362 1
R-Y250696 1
J-Y92462 1
J-Z2285 1
R-Y95829 1
R-FTC99691 1

Amostras em destaque Mais amostras →

AmostraY-DNAmtDNACultura / Período
R083 J-TY491551 —
R013 R-Y65452 —
R068 R-SK2014 —
R018 R-FGC52936 —
R003 J-FT249691 —
R086 G-Z6764 —
R001 T-Y152024 —
R002 R-Z2110 —
R004 Q-FT387652 —
R005 J-Y144533 —