祖源树 Авторизоваться Научный Древние ДНК-документы

High-Coverage Jomon Genomes Provide Insights into Population Structure and Genetic Traits of Ancient Japanese Hunter-Gatherers

Полногеномные данные дзёмонских популяций проливают свет на структуру популяции и генетические особенности древних японских охотников-собирателей
PRJDB39740 Оригинальная статья / DOI2025-12-166 образцов (исследование)

ИИ-интерпретацияСгенерировано ИИ

Высокопокровные геномы дзёмон уточняют вклад древних охотников-собирателей в современных японцев.

Учёные проанализировали восемь полных геномов людей эпохи дзёмон (9000–2800 лет назад) со всей Японии. Оказалось, что, несмотря на разное время и места, populations были генетически очень похожи — следствие изоляции после ледникового периода. Но древнейшие представители (начальный дзёмон, стоянка Ияй) всё же образуют отдельную раннюю ветвь. Главное: вклад дзёмон в современных японцев оценили в ~20%, а не ~13%, как считалось раньше. Также найдены генетические предрасположенности: выше индекс массы тела, метаболические показатели, меньше иммунных, больше размер сердца — типично для охотников-собирателей.

Интерпретация образцов

В анализ вошли 3 образца из стоянки DRR893171, все отнесены к начальному дзёмону. По Y-хромосоме определены три разные линии: D-CTS220, D-Z1513 и D-CTS4292 — по одному образцу. Митохондриальные гаплогруппы: N9b у двух и N9b3 у одного. Эти данные показывают, что даже в небольшой выборке присутствует разнообразие мужских линий при преобладании женской N9b.

Для любителей генеалогии

Для любителей родословных это означает, что древние дзёмон — не просто далёкие предки, а значимая часть (~20%) генома современных японцев. Их адаптации, включая риски ожирения и дислипидемии, до сих пор влияют на здоровье. Гаплогруппы D и N9b — прямые маркеры этой древней линии.

Аннотация

Мы проанализировали восемь геномов дзёмон с высоким покрытием, охватывающих период от 9 000 до 2 800 лет назад на территории Японского архипелага. Популяционно-геномные анализы выявили существенную генетическую однородность во времени и пространстве, отражающую послеледниковую изоляцию, однако обнаружилась временная стратификация: особи начального дзёмон (Ияй) образовали наиболее раннюю ветвь со более слабым родством с современными японцами. Используя геномы из стоянок Тодороки и Тидорикубо, мы оценили долю предковой дзёмонской компоненты у населения материковой Японии примерно в 20%, что существенно выше предыдущих оценок (~13%). Анализы полигенных баллов, основанные на непосредственном анализе дзёмонских геномов, предоставили генетические свидетельства их фенотипических предрасположенностей, включая повышенные показатели индекса массы тела и метаболических признаков, сниженные показатели, связанные с иммунитетом, и большие размеры сердца, что соответствует адаптациям охотников-собирателей. Эти предковые генетические влияния, включая повышенные риски ожирения и дислипидемии, сохраняются у современных японцев. Наши результаты демонстрируют, что популяции дзёмон поддерживали генетическую преемственность, несмотря на экологическое разнообразие, а их более значительный, чем ожидалось, вклад в генофонд современных японцев перестраивает модели популяционной истории и показывает, как древние адаптации продолжают влиять на современную предрасположенность к заболеваниям.

Образцы и данные на TheYtree

3образцов на сайте
3Y-гаплогруппа определена
1археологических памятников

Карта образцов

Тайлы карты от TheYtree · размер точки = число образцов

Отцовские (Y-ДНК) гаплогруппы

ГаплогруппаОбразцы
D-CTS4292 1
D-CTS220 1
D-Z1513 1

Материнские (мтДНК) гаплогруппы

Избранные образцы Больше образцов →

ОбразецY-DNAmtDNAКультура / период
Iyai4 D-CTS220 N9b3 Initial Jomon· 7341 ± 35 cal BP
Iyai15 D-CTS4292 N9b Initial Jomon· 7438 ± 23 cal BP
Iyai18 D-Z1513 N9b Initial Jomon· 7544 ± 26 cal BP