Lethal plague outbreaks in Lake Baikal hunter-gatherers 5,500 years ago

Чума является одним из самых разрушительных заболеваний в истории человечества1. Однако ранние штаммы вызывающей чуму бактерии Yersinia pestis не имели факторов вирулентности, необходимых для бубонной формы, вплоть до примерно 3 800 лет назад2,3. Следовательно, заболеваемость и смертность от ранних штаммов чумы остаются неясными. Здесь мы описываем ранние штаммы чумы, которые связаны с двумя фазами вспышек среди охотников-собирателей среднего голоцена вблизи озера Байкал на юго-востоке Сибири, начиная примерно с 5 500 лет назад. Эти вспышки происходят на территории четырёх кладбищ охотников-собирателей, при этом частота обнаружения чумной инфекции составляет 39%. Путём реконструкции родословных по родству мы показываем, что были затронуты небольшие семейные группы, что согласуется с передачей заболевания от человека к человеку, и что первая вспышка произошла в пределах одного поколения. Инфекции, по-видимому, приводили к острой смертности, особенно среди детей (в возрасте от 8 до 11 лет). Мы далее отмечаем функциональные различия, в том числе в локусе суперантигена ypm, который также присутствует у современной Yersinia pseudotuberculosis. Новые штаммы ancestrally расходятся с известными Y. pestis и ограничивают время её появления, указывая на то, что это произошло ранее примерно 5 700 лет назад. Эти findings показывают, что вспышки чумы происходили раньше, чем считалось ранее, и действительно были летальными. Мы утверждаем, что возникновение вспышек среди сообществ охотников-собирателей среднего голоцена, находящихся далеко за пределами сферы поздненеолитической Европы, ставит под сомнение представление о том, что более высокая плотность населения и изменения образа жизни в ходе неолитического перехода к земледелию были предпосылками для эпидемий чумы.