祖源树 Авторизоваться Научный Древние ДНК-документы

Medieval Mongolian aDNA PMD benchmark

Средневековый монгольский aDNA PMD-бенчмарк
PRJEB112497 2026-09-072 образцов (исследование)

ИИ-интерпретацияСгенерировано ИИ

Древняя ДНК монголов: как методы коррекции повреждений влияют на родство.

Учёные сравнили три способа обработки древней ДНК на двух средневековых монголах из могильника Орцог-Овоо (XIII–XIV вв.). Использовали парные библиотеки: с полной обработкой урацил-ДНК-гликозилазой (full-UDG) и без неё. Проверяли, как методы влияют на поддержку аллелей, сохранность сайтов, согласованность импутации и вывод о родстве. Генетика подтвердила связь родитель–ребёнок. Ни один метод не оказался лучшим по всем показателям.

Интерпретация образцов

В выборке всего два индивида из могильника Орцог-Овоо (Монгольская империя, XIII–XIV вв.). У обоих определена митохондриальная гаплогруппа D4o1. Y-гаплогруппа не разрешена. Данных мало для популяционных выводов, но достаточно для методического сравнения и проверки родства.

Для любителей генеалогии

Для любителей родословных: даже при родстве родитель–ребёнок выбор метода обработки древней ДНК может менять результаты. Осторожно интерпретируйте совпадения и проверяйте, как обработаны данные.

Аннотация

Этот проект сравнивает терминальную обрезку, перемасштабирование базовых качеств mapDamage2 и маскирование известных SNP bamRefine в согласованных библиотеках, полностью обработанных урацил-ДНК-гликозилазой (full-UDG) и не обработанных UDG, от двух средневековых монгольских индивидов, ORT15 и ORT16, из Оорцог Овоо (тринадцатый и четырнадцатый века н. э.). Мы оценивали поддержку аллелей, связанных с повреждениями, сохранение сайтов, согласованность импутации между библиотеками и вывод о родстве. Генетические данные подтвердили связь родитель–потомок, и ни один метод коррекции не показал наилучших результатов по всем показателям. Набор данных включает парноконцевое полногеномное секвенирование на Illumina NovaSeq X двуцепочечных библиотек, приготовленных из каменистой кости.

Образцы и данные на TheYtree

2образцов на сайте
0Y-гаплогруппа определена

Материнские (мтДНК) гаплогруппы