祖源树 Авторизоваться Научный Древние ДНК-документы

From bones to sediments: ancient human DNA from open-air archaeological sites

От костей к отложениям: древняя ДНК человека из открытых археологических памятников
PRJEB87497 Оригинальная статья / DOI2026-03-024 образцов (исследование)

ИИ-интерпретацияСгенерировано ИИ

Древняя ДНК из почвы раскрывает митохондриальные линии двух японских стоянок.

Учёные извлекли ДНК из отложений на двух открытых археологических памятниках: замок Кацурэн на Окинаве (XII–XIII вв.) и стоянка Осима 2 на Хоккайдо (XI–XII вв.). Они сравнили ДНК из почвы внутри черепов, вокруг костей и вне могил с ДНК из самих костей. Используя секвенирование и обогащение митохондриальной ДНК, исследователи проверили, можно ли надёжно определять митохондриальные гаплогруппы по грунту. Это первый шаг к изучению древних людей там, где кости плохо сохранились.

Интерпретация образцов

В выборке представлено 4 образца с разрешёнными митохондриальными гаплогруппами. Наиболее частой оказалась M7a1b1 (2 образца), затем по одному образцу D4a1 и D4j. Y-гаплогруппы не определены. Эти линии характерны для Восточной Азии и Японии, что согласуется с географией памятников.

Для любителей генеалогии

Для любителей родословных это означает, что древнюю ДНК можно получать не только из костей, но и из почвы. Это расширяет возможности изучения популяций прошлого, особенно там, где скелеты не сохранились.

Аннотация

Было собрано пять образцов осадка на месте захоронения, замке Кацурэн, расположенном на Окинаве, которое датируется серединой XII — началом XIII века периода Гусуку (рис. 1). Здесь под стеной замка были обнаружены два захоронения с скелетными останками. Один образец осадка изнутри черепа был собран из ямы 138. Из ямы 178 было получено четыре образца осадка: один изнутри черепа, один из осадка вокруг тазовых костей, один из осадка вокруг рёберных костей и один из области за пределами ямы (рис. 1, таблица S1). Кроме того, от каждого индивида была собрана одна рёберная кость для сравнения с результатами, полученными из осадков. Второй памятник — это поселенческий памятник, известный как Осима 2, который датируется XI–XII веками периода Сацумон и расположен на Хоккайдо (рис. 1). Мы собрали одиннадцать образцов осадка из различных контекстов в пределах памятника (рис. S1, таблица S2). ДНК была экстрагирована из всех образцов и секвенирована с использованием платформ Illumina NovaSeq и iSeq (см. Методы). Мы выполнили комбинацию полногеномного секвенирования (от 12447839 до 85971229 числа прочтений) и целевого обогащения с захватом для человеческой мтДНК (от 70064 до 2174014 числа прочтений), чтобы исследовать возможность определения гаплогрупп человеческой мтДНК из образцов осадка на открытых археологических памятниках.

Образцы и данные на TheYtree

4образцов на сайте
0Y-гаплогруппа определена

Материнские (мтДНК) гаплогруппы