祖源树 Авторизоваться Научный Древние ДНК-документы

Genetic Evidence of Yersinia pestis from the First Pandemic

Генетические свидетельства Yersinia pestis из первой пандемии
PRJNA1303691 Оригинальная статья / DOI2025-07-3112 образцов (исследование)

ИИ-интерпретацияСгенерировано ИИ

Древняя ДНК чумы из Иордании связала первую пандемию с её историческим очагом.

Учёные исследовали массовое захоронение VI–VII веков в Джераше (Иордания). Сначала белковый скрининг указал на возможного возбудителя, затем из пяти скелетов выделили и прочитали древнюю ДНК Yersinia pestis. Геномы оказались почти идентичными и попали в одну ветвь с другими штаммами Первой пандемии. Это первое геномное подтверждение чумы в Восточном Средиземноморье — рядом с предполагаемым очагом Юстиниановой чумы.

Интерпретация образцов

В выборке 12 образцов, у 11 определена Y-гаплогруппа. Все они относятся к гаплогруппе R и её ветвям: R-L754 (2), R (2), R-P297, R-L2, R-FGC46820, R1, R-FGC46209, R-S8183 (по 1). Митохондриальная ДНК указана лишь для одного образца как N/A, поэтому по материнским линиям данных нет. Культурная принадлежность в таблице не указана.

Для любителей генеалогии

Для любителей древних миграций это напоминание: патогены тоже путешествуют и оставляют след в ДНК. Y-линии R у жертв чумы VI века показывают, что в Джераше жили носители западноевразийских отцовских линий, но выборка мала и не отражает всё население.

Аннотация

Чума Юстиниана ознаменовала начало Первой пандемии (541–750 гг. н. э.), однако до сих пор не было получено геномных доказательств присутствия Yersinia pestis в Восточном Средиземноморье, где вспышка была впервые зафиксирована. Целью данного исследования было определить, присутствовала ли Y. pestis в массовом захоронении середины VI — начала VII века в Джераше, Иордания, и охарактеризовать её геном в более широком контексте штаммов Первой пандемии. Методы: Мы проанализировали образцы от нескольких индивидов, обнаруженных в массовом захоронении в Джераше. Первоначальный скрининг на потенциальное присутствие патогена проводился с использованием протеомики. Избранные образцы были подвергнуты экстракции древней ДНК и полногеномному секвенированию. Сравнительный геномный и филогенетический анализы были проведены для оценки идентичности штамма и его эволюционного положения. Результаты: Геномное секвенирование выявило ДНК Y. pestis у пяти индивидов, обнаружив высокосходные геномы. Все штаммы тесно кластеризовались с другими линиями Первой пандемии, но были впервые обнаружены в регионе, географически близком к историческому эпицентру пандемии. Почти идентичные геномы у различных индивидов указывают на вспышку одной циркулирующей линии во время данной вспышки. Выводы: Данное исследование предоставляет первые геномные доказательства присутствия Y. pestis в Восточном Средиземноморье в период Первой пандемии, связывая археологические находки с геномикой патогена вблизи точки происхождения Юстиниановой чумы. Краткое предложение: Геномные доказательства связывают Y. pestis с Первой пандемией в древнем городе.

Образцы и данные на TheYtree

12образцов на сайте
11Y-гаплогруппа определена

Отцовские (Y-ДНК) гаплогруппы

ГаплогруппаОбразцы
R-L754 2
R 2
R1 1
R-FGC46209 1
R-S8183 1
R-M269 1
R-P297 1
R-L2 1
R-FGC46820 1

Материнские (мтДНК) гаплогруппы

Избранные образцы Больше образцов →

ОбразецY-DNAmtDNAКультура / период
N1_S1 R-P297 — · early 7th century
N2_S2 R-S8183 — · early 7th century
N3_S3 R — · early 7th century
N4_S4 R — · early 7th century
N6_S2 R1 — · early 7th century
N7_S3 R-L754 — · early 7th century
N8_S4 R-FGC46820 — · early 7th century
Sample_1 R-L2 — · early 7th century
Sample_2 R-L754 — · early 7th century
Sample_3 R-M269 — · early 7th century