High-coverage paleo-genome research identifies a pathogenic mutation on EXT1 in a Qing-period Chinese individual with multiple osteochondromas

Yüksek kapsamlı paleo-genom araştırması, multipl osteokondromlu Qing dönemi bir Çinli bireyde EXT1 üzerinde patojenik bir mutasyon tanımlar

PRJCA069372 Orijinal makale / DOI2026-07-251 örnek (çalışma)

Yapay zekâ yorumuYapay zekâ üretimi

Çing dönemi Shandong bireyinde EXT1 geninde kalıtsal bir mutasyon bulundu.

Bu çalışma, Çin'in Shandong bölgesinden Çing dönemine ait bir bireyin kaya kemiğinden alınan antik DNA ile tüm ekzom dizilemesi yapıldığını anlatıyor. Ortalama 27,172× kapsama derinliğiyle EXT1 geninde c.791T>C (p.Leu264Pro) patojenik heterozigot mutasyonu tespit edilmiş. Bu mutasyon, çoklu osteokondrom (MO) hastalığıyla ilişkili ve modern bir Latin Amerika hastasında da görülmüş. Protein yapı analizleri, mutasyonun yapısal ve işlevsel hasara yol açtığını gösteriyor.

EXT1 geninde c.791T>C (p.Leu264Pro) patojenik heterozigot mutasyonu bulundu.
Mutasyon, EXT1 proteininin ligand bağlama bölgesindeki Rossmann-2 alt alanında yer alıyor.
Aynı mutasyon, akraba olmayan modern bir Latin Amerika hastasında da rapor edilmiş.

Örnek yorumu

Analiz edilen tek birey, Çing dönemi Shandong'undan bir erkek. Y kromozomu O-TYT63912, mitokondriyal DNA'sı G1c olarak belirlenmiş. Bu, antik DNA'dan yüksek kapsama ile elde edilen nadir bir örnek. Bireyin iskelet kalıntıları daha önce MO şüphesiyle tanımlanmıştı ve bu çalışma genetik tanıyı doğruluyor.

Soy meraklıları için

Bu bulgu, nadir hastalıkların antik DNA ile teşhis edilebileceğini gösteriyor. EXT1 mutasyon spektrumunu genişletiyor ve Kuzey Çin'in eski hastalık haritasına katkı sağlıyor. Soy meraklıları için, antik bireylerin genetik hastalık taşıyıcısı olabileceğini ve Y-DNA ile mtDNA'nın hastalıkla ilişkisiz olduğunu vurguluyor.

Özet

Multiple osteokondromlar (MO), morfolojik ve radyolojik olarak fenotipik benzerlik gösteren hastalıklardan ayırt edilmesini zorlaştıran değişken belirtiler gösteren nadir bir kemik hastalığıdır. EXT1 veya EXT2 mutasyonlarıyla ilişkili monogenik bir bozukluk olarak, antik DNA analizi, şüpheli vakalarda genetik olarak doğrulanmış tanılar ve patogeneze dair içgörüler sağlayabilir. Çin'in Qing dönemi Shandong bölgesinden daha önce bildirilen şüpheli bir MO vakasını daha fazla araştırmak için, bireyin petröz kemiğinden antik tüm ekzom dizileme verisi ürettik ve ortalama 27,172× dizileme kapsamı elde ettik. EXT1'in ligand bağlanma bölgesi Rossmann-2 alt alanında patojenik bir heterozigot mutasyon (c.791T > C; p.Leu264Pro) tanımladık; bu mutasyon 17× dizileme derinliğinde tespit edildi ve aynı mutasyon akraba olmayan modern bir Latin Amerikalı hastada da bulunmuştur. Ek olarak, EXT1 proteininin 3D yapısını tahmin ederek ve analiz ederek yapısal ve işlevsel hasar tespit ettik. Bulgularımız, bilinen EXT1 mutasyon spektrumunu genişletmekte ve nadir MO'nun kapsamlı genotip-fenotip haritasını güçlendirmekte, tarihsel bir perspektiften genetik patolojisine dair içgörüler sunmaktadır. Ayrıca bu araştırma, Kuzey Çin'deki hastalık manzaralarının anlaşılmasını hem paleopatolojik hem de paleogenetik açıdan genişletmektedir.

TheYtree'deki örnekler ve veriler

1sitedeki örnekler

1Y haplogrubu belirlendi

Babasal (Y-DNA) haplogrupları

Haplogrup	Örnekler
O-TYT63912	1

Anasoyu (mtDNA) haplogrupları

G1c · 1

Öne çıkan örnekler Daha fazla örnek →

Örnek	Y-DNA	mtDNA	Kültür / Dönem
IC2613(HRR3435266)-清代	O-TYT63912	G1c	· 清代 Qing Dynasty