祖源树 Oturum aç Bilimsel Antik DNA Kağıtları

Medieval Mongolian aDNA PMD benchmark

Orta Çağ Moğol aDNA PMD kıyaslama seti
PRJEB112497 2026-09-072 örnek (çalışma)

Yapay zekâ yorumuYapay zekâ üretimi

Ortaçağ Moğol bireylerinde antik DNA hasar düzeltme yöntemlerinin karşılaştırması.

Bu çalışma, 13.-14. yüzyıllarda Moğolistan'daki Oortsog Ovoo'da yaşamış iki bireyin (ORT15 ve ORT16) kemik örneklerinden alınan antik DNA'yı inceliyor. Full-UDG ve non-UDG kütüphaneleri karşılaştırılarak üç farklı hasar düzeltme yöntemi (uç kırpma, mapDamage2 yeniden ölçekleme, bamRefine maskeleme) test edilmiş. Genetik veriler bu iki bireyin ebeveyn-çocuk ilişkisinde olduğunu destekliyor.

Örnek yorumu

Çalışmada yalnızca 2 birey bulunuyor: ORT15 ve ORT16. Her ikisinin de mitokondriyal haplogrubu D4o1 olarak belirlenmiş. Y kromozomu haplogrubu çözümlenememiş. Kültürel bağlam Ortaçağ Moğol İmparatorluğu dönemine işaret ediyor. Örnekler petröz kemikten hazırlanan çift sarmallı DNA kütüphanelerinden elde edilmiş.

Soy meraklıları için

Antik DNA çalışmalarında hasar düzeltme yöntemi seçiminin sonuçları etkileyebileceğini gösteriyor. Moğol İmparatorluğu dönemine ait bireylerin akrabalık ilişkilerini anlamak için değerli bir referans sunuyor.

Özet

Bu proje, Oortsog Ovoo'dan (MS on üçüncü ve on dördüncü yüzyıllar) iki Orta Çağ Moğol bireyi olan ORT15 ve ORT16'nın eşleştirilmiş tam urasil-DNA glikozilaz ile muamele edilmiş (tam-UDG) ve UDG uygulanmamış kütüphanelerinde terminal kırpma, mapDamage2 baz kalitesi yeniden ölçeklendirmesi ve bamRefine bilinen-SNP maskelemesini karşılaştırmaktadır. Hasar ile ilişkili alel desteğini, bölge tutulumunu, kütüphaneler arası imputasyon uyumunu ve akrabalık çıkarımını değerlendirdik. Genetik kanıtlar bir ebeveyn-yavru ilişkisini destekledi ve hiçbir düzeltme yöntemi tüm ölçütlerde en iyi performansı göstermedi. Veri seti, petröz kemikten hazırlanan çift sarmallı kütüphanelerin Illumina NovaSeq X eşleştirilmiş uçlu tüm genom dizilemesini içermektedir.

TheYtree'deki örnekler ve veriler

2sitedeki örnekler
0Y haplogrubu belirlendi

Anasoyu (mtDNA) haplogrupları