祖源树 Oturum aç Bilimsel Antik DNA Kağıtları

Evolution of immune genes is associated with the Black Death

Bağışıklık genlerinin evrimi Kara Ölüm ile ilişkilidir
PRJNA798381 Orijinal makale / DOI2022-10-19206 örnek (çalışma)

Yapay zekâ yorumuYapay zekâ üretimi

Kara Ölüm, bağışıklık genlerimizi nasıl şekillendirdi?

Veba salgını, tarihin en büyük ölüm olayıydı. Bilim insanları, salgından önce, sırasında ve sonrasında yaşamış 206 kişinin antik DNA'sını inceleyerek bağışıklık genlerindeki değişimleri araştırdı. Bağışıklık genlerinde güçlü bir seçilim izi buldular; özellikle ERAP2 geni yakınındaki bir varyant, vebaya karşı koruma sağlamış görünüyor. Bu koruyucu varyantlar bugün otoimmün hastalıklara yatkınlıkla da ilişkili.

Örnek yorumu

Bu çalışmada 206 antik DNA örneği incelendi. Örnekler, Avrupa'da iki farklı popülasyondan (Londra ve Danimarka) salgın öncesi, sırası ve sonrası dönemlere ait. Site istatistiklerinde yalnızca 1 örnek ve 1 Y-DNA haplogrubu (E-M132) görünüyor; bu, veri setinin çok küçük bir kısmını temsil ediyor. Yine de antik DNA analizi, seçilim sinyallerini yakalamak için yeterli.

Soy meraklıları için

Kara Ölüm gibi salgınlar, bugünkü bağışıklık çeşitliliğimizi ve otoimmün hastalık riskimizi etkilemiş olabilir. Bu, geçmiş salgınların modern sağlığımızı nasıl şekillendirdiğini gösteriyor.

Özet

Bulaşıcı hastalıklar, insan evrimini yönlendiren en güçlü seçilim baskıları arasındadır1,2. Bu durum, kayıtlı tarihin en büyük ölüm olayını, genellikle Kara Ölüm olarak adlandırılan veba salgınının ikinci pandemisinin ilk patlak vermesini içerir ve bu salgına Yersinia pestis bakterisi neden olmuştur3. Bu pandemi Afro-Avrasya'yı harap etmiş ve nüfusun %30-50'sine kadarını öldürmüştür4. Kara Ölüm sırasında seçilim altında olmuş olabilecek lokusları belirlemek için, Kara Ölüm öncesi, sırası ve sonrasında iki farklı Avrupa popülasyonundan elde edilen 206 antik DNA örneğinden bağışıklıkla ilişkili genler çevresindeki genetik varyasyonu karakterize ettik. Bağışıklık lokusları, bir dizi bağışıklık dışı lokusa kıyasla yüksek düzeyde farklılaşmış bölgeler açısından güçlü şekilde zenginleşmiştir ve bu da pozitif seçilime işaret etmektedir. Londra veri seti içinde yüksek düzeyde farklılaşmış 201 varyant belirledik. Kara Ölüm sırasındaki kanıtları, Danimarka'daki replike popülasyonumuzu ve işlevsel kanıtları birleştirdiğimizde, ERAP2 yakınındaki rs2549794 pozitif seçilim için en güçlü aday olarak ortaya çıkmaktadır. rs2549794'teki seçilmiş alel, tam uzunlukta (kısaltılmışa karşı) ERAP2 transkriptinin üretimi, Y. pestis'e karşı sitokin yanıtındaki varyasyon ve makrofajlarda hücre içi Y. pestis'i kontrol etme yeteneğinin artmasıyla ilişkilidir. Son olarak, koruyucu varyantların bugün otoimmün hastalıklara artmış duyarlılıkla ilişkili alellerle örtüştüğünü göstererek, geçmiş pandemilerin günümüzde hastalığa duyarlılığı şekillendirmede oynadığı role dair ampirik kanıt sunmaktayız.

TheYtree'deki örnekler ve veriler

1sitedeki örnekler
1Y haplogrubu belirlendi

Babasal (Y-DNA) haplogrupları

HaplogrupÖrnekler
E-M132 1

Öne çıkan örnekler Daha fazla örnek →

ÖrnekY-DNAmtDNAKültür / Dönem
LP164 E-M132 —