Lethal plague outbreaks in Lake Baikal hunter-gatherers 5,500 years ago

Dịch hạch là một trong những căn bệnh tàn khốc nhất trong lịch sử loài người1. Tuy nhiên, các chủng vi khuẩn Yersinia pestis gây bệnh dịch hạch thời kỳ đầu đã thiếu các yếu tố độc lực cần thiết cho thể hạch cho đến khoảng 3.800 năm trước2,3. Do đó, tỷ lệ mắc bệnh và tử vong của các chủng dịch hạch thời kỳ đầu vẫn chưa rõ ràng. Ở đây chúng tôi mô tả các chủng dịch hạch thời kỳ đầu liên quan đến hai giai đoạn bùng phát dịch bệnh trong cộng đồng săn bắt hái lượm giữa Holocene gần hồ Baikal ở đông nam Siberia, bắt đầu từ khoảng 5.500 năm trước. Những đợt bùng phát này xảy ra trên bốn nghĩa địa của cộng đồng săn bắt hái lượm, với tỷ lệ phát hiện nhiễm dịch hạch là 39%. Bằng cách tái dựng phả hệ huyết thống, chúng tôi cho thấy rằng các nhóm gia đình nhỏ bị ảnh hưởng, phù hợp với sự lây lan bệnh từ người sang người, và đợt bùng phát đầu tiên xảy ra trong vòng một thế hệ. Các ca nhiễm trùng dường như đã dẫn đến tử vong cấp tính, đặc biệt ở trẻ em (từ 8 đến 11 tuổi). Chúng tôi tiếp tục ghi nhận những khác biệt về chức năng, bao gồm ở locus siêu kháng nguyên ypm, locus này cũng hiện diện ở Yersinia pseudotuberculosis ngày nay. Các chủng mới phân kỳ tổ tiên so với Y. pestis đã biết và giới hạn thời điểm xuất hiện của nó, cho thấy điều này đã xảy ra trước khoảng 5.700 năm trước. Những phát hiện này cho thấy các đợt bùng phát dịch hạch đã xảy ra sớm hơn so với suy nghĩ trước đây và thực sự gây chết người. Chúng tôi cho rằng sự xuất hiện của các đợt bùng phát trong các cộng đồng săn bắt hái lượm giữa Holocene nằm ngoài phạm vi châu Âu Thời đại Đồ đá Mới Muộn thách thức quan điểm cho rằng mật độ dân số cao hơn và những thay đổi lối sống trong quá trình chuyển đổi nông nghiệp thời Đồ đá Mới là điều kiện tiên quyết cho các đại dịch dịch hạch.