祖源树 Đăng nhập Nghiên cứu Cổ đại Bài báo

Medieval Mongolian aDNA PMD benchmark

Chuẩn đối chiếu PMD aDNA Mông Cổ thời Trung cổ
PRJEB112497 2026-09-072 mẫu (nghiên cứu)

Giải thích bằng AIDo AI tạo

Hai cá thể Mông Cổ thời trung cổ: so sánh phương pháp xử lý DNA cổ và xác nhận quan hệ cha mẹ - con cái.

Nghiên cứu so sánh ba cách xử lý dữ liệu DNA cổ (cắt đầu, hiệu chỉnh chất lượng base, che SNP) trên hai thư viện (có và không có UDG) từ hai cá thể Mông Cổ thế kỷ 13-14 tại Oortsog Ovoo. Kết quả cho thấy không có phương pháp nào vượt trội toàn diện, nhưng bằng chứng di truyền xác nhận mối quan hệ cha mẹ - con cái giữa ORT15 và ORT16. Đây là dữ liệu giải trình tự toàn hệ gen từ xương đá tai.

Giải thích mẫu

Chỉ có 2 mẫu từ di chỉ Oortsog Ovoo, niên đại thế kỷ 13-14, thuộc văn hóa Mông Cổ thời Đế chế Mông Cổ. Cả hai đều có hệ gen ty thể D4o1, nhưng không có mẫu Y nào được phân giải. Số lượng mẫu rất nhỏ, chỉ đủ để so sánh kỹ thuật và nhận định sơ bộ về quan hệ huyết thống.

Dành cho người yêu thích gia phả

Với người yêu thích nguồn gốc, nghiên cứu nhấn mạnh tầm quan trọng của việc chọn phương pháp xử lý DNA cổ phù hợp. Dù mẫu ít, nó cung cấp bằng chứng về cấu trúc gia đình Mông Cổ thời trung cổ và cảnh báo không nên dựa vào một phương pháp duy nhất khi phân tích.

Tóm tắt

Dự án này so sánh việc cắt tỉa đầu tận cùng, hiệu chỉnh chất lượng base của mapDamage2 và che giấu SNP đã biết của bamRefine trong các thư viện được xử lý bằng uracil-DNA glycosylase đầy đủ (full-UDG) và không xử lý UDG tương ứng từ hai cá thể người Mông Cổ thời trung cổ, ORT15 và ORT16, từ Oortsog Ovoo (thế kỷ mười ba và mười bốn CN). Chúng tôi đánh giá sự hỗ trợ allele liên quan đến tổn thương, sự giữ lại vị trí, sự đồng thuận suy luận chéo thư viện và suy luận mối quan hệ họ hàng. Bằng chứng di truyền ủng hộ mối quan hệ cha mẹ-con cái, và không có phương pháp hiệu chỉnh nào hoạt động tốt nhất trên tất cả các thước đo. Bộ dữ liệu bao gồm giải trình tự toàn bộ hệ gen paired-end bằng Illumina NovaSeq X của các thư viện sợi kép được chuẩn bị từ xương đá.

Mẫu và dữ liệu trên TheYtree

2mẫu trên trang
0đã xác định nhóm haplo Y

Nhóm haplo dòng mẹ (mtDNA)