祖源树 Đăng nhập Nghiên cứu Cổ đại Bài báo

High incidence of AZF duplications in clan-structured Iranian populations detected through Y chromosome sequencing read depth analysis

Tần suất cao các bản sao AZF trong các quần thể Iran có cấu trúc thị tộc được phát hiện qua phân tích độ sâu đọc giải trình tự nhiễm sắc thể Y
PRJEB61684 Bài báo gốc / DOI2023-07-2287 mẫu (nghiên cứu)

Giải thích bằng AIDo AI tạo

Nghiên cứu phát hiện tần suất nhân bản AZF cao bất thường ở các dòng họ Iran theo phụ hệ.

Nhóm tác giả dùng phương pháp đọc độ sâu từ giải trình tự NGS để tìm các tái cấu trúc vùng AZFb/c trên nhiễm sắc thể Y của 87 người Iran thuộc nhiều sắc tộc. Kết quả cho thấy tần suất nhân bản ở Iran cao gấp đôi so với dữ liệu 1000 Genomes. Đáng chú ý, hầu hết nhân bản xuất hiện ở các nhóm theo dòng cha, có thể do kích thước quần thể đực hiệu quả nhỏ làm giảm chọn lọc tiêu cực. Họ cũng tìm thấy một nhân bản lớn 8,0 Mb, làm tăng gấp bốn lần số bản sao gen AZFc – lớn nhất từng được báo cáo ở vùng này.

Giải thích mẫu

Mẫu gồm 87 nam giới Iran từ các nhóm sắc tộc khác nhau, tất cả đều phân giải được nhánh Y. Các haplogroup phổ biến nhất là T-TY491558 (3 mẫu), J-TY491553, J-Y83029, J-TY491551 và N-Y37153 (mỗi nhánh 2 mẫu). Ngoài ra có các mẫu đơn lẻ thuộc R-FTF19244, J-FGC32753 và G-BY202563. Dữ liệu này cho thấy cấu trúc dòng họ theo phụ hệ rõ rệt, phù hợp với giả thuyết về quần thể đực hiệu quả nhỏ.

Dành cho người yêu thích gia phả

Với người quan tâm nguồn gốc, kết quả nhắc rằng không chỉ mất đoạn AZF mà cả nhân bản AZF cũng cần được xem xét khi tìm hiểu vô sinh nam, đặc biệt ở các quần thể theo dòng họ phụ hệ. Điều này giúp giải thích vì sao một số dòng Y có thể tích lũy bất thường cấu trúc mà không bị chọn lọc loại bỏ.

Tóm tắt

Vùng ampliconic của nhiễm sắc thể Y ở người bao gồm các trình tự lặp lại lớn có thể trải qua tái tổ hợp tương đồng không alen (NAHR), dẫn đến các sắp xếp lại cấu trúc có thể gây vô sinh, đặc biệt khi chúng xảy ra ở vùng yếu tố vô tinh b/c (AZFb/c). Mặc dù các đột biến lặp đoạn AZF từ lâu đã bị bỏ qua do những hạn chế kỹ thuật của các nghiên cứu dựa trên STS vốn chủ yếu tập trung vào các đột biến mất đoạn, các công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS) gần đây đã cung cấp bằng chứng về tầm quan trọng của chúng đối với khả năng sinh sản. Trong nghiên cứu này, phương pháp tiếp cận độ sâu đọc NGS đã được sử dụng để phát hiện các sắp xếp lại AZFb/c ở 87 người Iran thuộc các nhóm dân tộc khác nhau. Tần suất lặp đoạn ở Iran được chứng minh là cao gấp đôi so với bộ dữ liệu "1000 Genomes". Điều thú vị là hầu hết các trường hợp lặp đoạn được tìm thấy ở các nhóm dân tộc theo dòng cha, có thể là hệ quả của kích thước quần thể hiệu quả nam giới thấp hơn, điều này có thể chống lại chọn lọc tiêu cực. Hơn nữa, chúng tôi đã tìm thấy một đột biến lặp đoạn lớn 8,0 Mb, dẫn đến sự gia tăng gấp bốn lần số bản sao của các gen AZFc, mà theo hiểu biết của chúng tôi là đột biến lặp đoạn lớn nhất từng được báo cáo ở vùng này. Nhìn chung, kết quả của chúng tôi gợi ý rằng điều quan trọng là không chỉ xem xét các đột biến mất đoạn AZF mà còn cả các đột biến lặp đoạn để điều tra nguyên nhân vô sinh nam, đặc biệt là ở các quần thể dựa trên thị tộc theo dòng cha.

Mẫu và dữ liệu trên TheYtree

87mẫu trên trang
87đã xác định nhóm haplo Y

Nhóm haplo dòng cha (Y-DNA)

Nhóm haploHiện đại
T-TY491558 3
J-TY491553 2
J-Y83029 2
J-TY491551 2
N-Y37153 2
J-CTS3601 1
E-Y2962 1
G-Z6764 1
E-FT1153 1
J-FGC30649 1
E-TY507677 1
N-F22331 1

Mẫu nổi bật Thêm mẫu →

MẫuY-DNAmtDNAVăn hóa / Thời kỳ
R083 J-TY491551 —
R013 R-Y65452 —
R068 R-SK2014 —
R018 R-FGC52936 —
R003 J-FT249691 —
R086 G-Z6764 —
R001 T-Y152024 —
R002 R-Z2110 —
R004 Q-FT387652 —
R005 J-Y144533 —