Reconstructing the West-East Genetic Division in Indonesia Using Ancient Genomes

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古DNA揭示印尼东西部遗传分化：先有旧石器基底，后经南岛扩张等迁徙叠加。

华莱士线是印尼东西部的生物地理分界，但遗传分化的起源一直不清楚。新研究分析了两例西印尼晚期新石器基因组，并结合19例已发表的岛屿东南亚古基因组。结果发现，东西部人群的分化早在全新世早期就已出现：西部采集者更接近和平文化相关人群，东部采集者更接近巴布亚相关人群。之后南岛语扩张等迁徙又强化并重塑了这一格局。

• 全新世早期，印尼西部采集者祖先更接近和平文化相关人群，东部则更接近巴布亚相关人群，东西分化早已存在。
• 新石器时代及之后，南岛语扩张、东南亚大陆基因流入西华莱士区、巴布亚相关人群回迁东华莱士区，叠加在早期分化之上。
• 现代印尼人群的遗传格局是全新世多次迁徙作用于原有区域差异的结果，而非单次事件造成。

樣本解讀

本研究新增2例西印尼晚期新石器基因组，Y染色体均属O单倍群（O-F3288和O-FT131196各1例），线粒体均为Y2a1（2例）。结合已发表的19例岛屿东南亚古基因组（距今7000至200年），样本覆盖东西华莱士区，为重建东西遗传分化提供了关键古代数据。

對祖源愛好者的意義

对祖源爱好者而言，这说明印尼东西部差异有深层旧石器基底，并非南岛扩张单独造成。看现代印尼人群时，需同时考虑早期区域分化与后期多次迁徙的叠加影响。