High-coverage paleo-genome research identifies a pathogenic mutation on EXT1 in a Qing-period Chinese individual with multiple osteochondromas

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清代山東一例疑似多發性骨軟骨瘤患者，古DNA證實帶有EXT1致病突變。

研究團隊從清代山東一例疑似多發性骨軟骨瘤（MO）患者的岩骨中提取古DNA，進行全外顯子定序，平均深度達27倍。結果在EXT1基因的配體結合區找到一個致病性雜合突變（c.791T>C），深度17倍，且該突變也見於一位無關的現代拉丁美洲患者。蛋白質三維結構預測顯示此突變造成結構與功能損傷，為這例古代疑似病例提供了基因層面的確診。

• 在清代山東個體的EXT1基因中發現致病性雜合突變c.791T>C（p.Leu264Pro），定序深度17倍。
• 該突變位於EXT1蛋白配體結合位點的Rossmann-2亞結構域，三維結構預測顯示造成結構與功能損傷。
• 此突變也見於一位無關的現代拉丁美洲患者，拓展了EXT1突變譜與MO的基因型-表型圖譜。

樣本解讀

站內樣本統計顯示，該清代山東個體僅1例，父系Y染色體歸屬於O-TYT63912，母系粒線體為G1c。由於樣本數只有1，這些單倍群資訊只能視為該個體的個人標記，不能代表清代山東人群的整體遺傳面貌。Y與mtDNA的解析度各為1例，也無法用來推論當時族群的遷徙或親緣關係，需更多古代樣本才能進行群體層次的比較。

對祖源愛好者的意義

對祖源愛好者而言，這項研究展示古DNA不只用來追溯血緣，也能從歷史個體身上確認罕見遺傳疾病的致病突變。它提醒我們，古代樣本同樣承載著疾病相關的遺傳資訊，可與現代患者比對，豐富我們對基因突變歷史分布的認識。