祖源树 登入 科研 古人 論文

High-Coverage Jomon Genomes Provide Insights into Population Structure and Genetic Traits of Ancient Japanese Hunter-Gatherers

高覆蓋率的繩文時代基因組為了解古代日本狩獵採集者的人口結構和遺傳特徵提供了重要線索
PRJDB39740 原始論文 / DOI2025-12-166 樣本(研究)

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高覆蓋率繩文基因組揭示日本狩獵採集者的遺傳延續與現代影響。

這項研究分析了八個距今九千至兩千八百年的繩文時代高覆蓋率基因組。結果顯示,繩文人群在時空上高度同質,反映冰後期隔離;但早期伊屋個體構成最早分支,與現代日本人親緣較弱。研究也重新估計現代日本本州人的繩文血統約兩成,比過去認為的一成三更高。

樣本解讀

站內樣本統計顯示,目前僅有三例繩文樣本,全部來自Initial Jomon文化,且父系Y染色體皆屬D單倍群,包括D-Z1513、D-CTS4292與D-CTS220;母系則以N9b為主,兩例N9b、一例N9b3。這些樣本來自同一遺址編號DRR893171,樣本量小且時空覆蓋有限,解讀時須留意代表性。

對祖源愛好者的意義

對祖源愛好者而言,這表示現代日本人的繩文祖源可能被低估,且繩文適應性基因仍影響今日代謝與疾病風險。站內D單倍群與N9b母系樣本可作為追蹤繩文父系與母系來源的參考,但樣本數少,不宜過度推論。

摘要

我們分析了橫跨日本列島、距今9,000至2,800年前的八個高覆蓋率繩文基因組。群體基因體分析揭示了在時間與空間上相當大的遺傳同質性,反映了冰期後的隔離,然而時間分層現象浮現:初始繩文(Iyai)個體形成了最早的分支,與現今日本人的親緣關係較弱。利用來自轟遺址與千鳥窪遺址的基因組,我們估計本土日本人的繩文祖源約為20%,大幅高於先前的估計(約13%)。多基因評分分析,基於對繩文基因組的直接分析,為其表型傾向提供了遺傳證據,包括較高的BMI與代謝性狀評分、較低的免疫相關評分,以及較大的心臟尺寸,這些模式與狩獵採集者的適應一致。這些祖先遺傳影響,包括肥胖與血脂異常風險升高,持續存在於現今日本人之中。我們的研究結果表明,繩文族群儘管生態多樣,仍維持了遺傳連續性,而他們對現今日本人的貢獻超出預期,重塑了群體歷史模型,並揭示了古代適應如何持續影響當代的疾病易感性。

TheYtree 上的樣本與資料

3站內樣本
3Y 單倍群已解析
1考古遺址

樣本地圖

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父系(Y-DNA)單倍群

單倍群現代人
D-Z1513 1
D-CTS4292 1
D-CTS220 1

母系(mtDNA)單倍群

樣本亮點 更多樣本 →

樣本Y-DNAmtDNA文化 / 時期
Iyai4 D-CTS220 N9b3 Initial Jomon· 7341 ± 35 cal BP
Iyai15 D-CTS4292 N9b Initial Jomon· 7438 ± 23 cal BP
Iyai18 D-Z1513 N9b Initial Jomon· 7544 ± 26 cal BP