Yersinia pestis strains from Latvia show depletion of the pla virulence gene at the end of the second plague pandemic

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拉脫維亞古DNA揭開鼠疫毒力基因pla在第二次大流行末期消失之謎。

科學家從拉脫維亞里加兩處17世紀墓地出土的16具遺骸牙齒中提取DNA，確認其中4人感染鼠疫耶爾森菌，並成功重建兩株古菌基因組。這兩株菌不聚在一起，顯示當地菌株多樣性。更關鍵的是，他們發現細菌同時攜帶兩種pPCP1質粒，一種含pla毒力基因，另一種缺失，且此模式普遍存在於後黑死病時期菌株，黑死病時期則無。pla基因對人類感染與傳播至關重要，其缺失可能導致鼠疫傳播力下降，進而促成18世紀歐洲鼠疫大流行的終結。

• 里加兩株鼠疫菌基因組不聚類，顯示後黑死病時期東歐菌株已有多樣性。
• 細菌同時攜帶含pla與缺失pla的兩種pPCP1質粒，此模式常見於後黑死病菌株。
• 黑死病時期菌株未見pla缺失模式，暗示pla毒力基因在流行末期逐漸流失。

樣本解讀

本研究共分析16具里加墓地遺骸，其中4具檢出鼠疫耶爾森菌DNA，2具足以重建基因組。父系Y染色體僅5例成功分型，包括N-Y15922（2例）、R-L23、T-L446與R-L51各1例；母系粒線體則以U5b1b1f和U5a2a1各2例為主，另有H5a1a、H1g1、W6a、H24b各1例。這些單倍群反映當地人群多元的遺傳背景，但樣本量小，不宜過度解讀。

對祖源愛好者的意義

對祖源愛好者而言，此研究提醒我們：古DNA不僅能追溯人群遷徙，也能追蹤病原體演化。鼠疫菌pla基因的流失可能改變疾病傳播，影響歷史人口結構。若你關注東歐祖源，這些樣本提供了17世紀里加地區的遺傳線索，但需留意樣本數有限。