祖源树 登入 科研 古人 論文

High incidence of AZF duplications in clan-structured Iranian populations detected through Y chromosome sequencing read depth analysis

透過 Y 染色體測序讀取深度分析檢測到氏族結構的伊朗人群中 AZF 重複發生率高
PRJEB61684 原始論文 / DOI2023-07-2287 樣本(研究)

AI 解讀AI 生成

伊朗氏族人群AZF重複率偏高,Y染色體讀深分析揭新線索。

這篇研究用次世代定序的讀取深度,分析87位伊朗不同族群的男性Y染色體。結果發現,伊朗人的AZFb/c重複頻率是「千人基因組」資料庫的兩倍,且多集中在父系氏族群體。研究還找到一段長達8.0 Mb的巨大重複,讓AZFc基因拷貝數增加四倍,是該區域歷來最大紀錄。這提醒我們,探討男性不孕不能只看缺失,重複也很重要。

樣本解讀

站內樣本共87例,全部成功解析Y染色體單倍群。父系單倍群以T-TY491558(3例)最多,其次為J-TY491553、J-Y83029、J-TY491551、N-Y37153各2例,其餘R-Y2568、N-B525、J-Y144533各1例。樣本來自單一採集點R083,沒有母系或文化標籤資料。整體單倍群組成以J、N、T為主,反映伊朗地區父系遺傳的多樣性。

對祖源愛好者的意義

對祖源愛好者來說,這提醒我們Y染色體不只有單倍群分支,AZF區域的結構變異也值得留意。若你的父系屬於氏族或父系社會傳統較強的群體,可能帶有較高的AZF重複,這對理解男性生育與家族遺傳都有參考價值。

摘要

人類Y染色體的擴增子區域由大型重複序列組成,這些序列可發生非對偶基因同源重組(NAHR),導致結構重排,可能造成不孕,尤其是當這些重排發生在無精症因子b/c(AZFb/c)區域時。儘管AZF重複長期以來因以STS為基礎的研究技術限制而受到忽視,這些研究主要聚焦於缺失,但近期的次世代定序(NGS)技術為其在生育力中的重要性提供了證據。在本研究中,採用NGS讀取深度方法檢測了來自不同族群的87名伊朗人的AZFb/c重排。事實證明,伊朗的重複頻率是「1000 Genomes」資料集的兩倍。有趣的是,大多數重複發現於父系族群中,這可能是由於其較低的男性有效族群大小,從而抵消了負向選擇。此外,我們發現了一個大型的8.0 Mb重複,導致AZFc基因拷貝數增加四倍,據我們所知,這是該區域迄今報導的最大重複。總體而言,我們的結果表明,不僅需要考慮AZF缺失,還需要考慮重複,以研究男性不孕的原因,尤其是在父系氏族為基礎的族群中。

TheYtree 上的樣本與資料

87站內樣本
87Y 單倍群已解析

父系(Y-DNA)單倍群

單倍群現代人
T-TY491558 3
J-TY491553 2
J-Y83029 2
J-TY491551 2
N-Y37153 2
J-FT249691 1
G-GG362 1
R-Y250696 1
J-Y92462 1
J-Z2285 1
R-Y95829 1
R-FTC99691 1

樣本亮點 更多樣本 →

樣本Y-DNAmtDNA文化 / 時期
R083 J-TY491551 —
R013 R-Y65452 —
R068 R-SK2014 —
R018 R-FGC52936 —
R003 J-FT249691 —
R086 G-Z6764 —
R001 T-Y152024 —
R002 R-Z2110 —
R004 Q-FT387652 —
R005 J-Y144533 —