祖源树 登入 科研 古人 論文

From bones to sediments: ancient human DNA from open-air archaeological sites

從骨骼到沉積物:來自露天考古遺址的古代人類DNA
PRJEB87497 原始論文 / DOI2026-03-024 樣本(研究)

AI 解讀AI 生成

露天遗址沉积物也能提取古人粒線體DNA,揭開沖繩與北海道的遺傳面貌。

這篇研究從沖繩勝連城與北海道大島2號兩個露天考古遺址,採集了共16個沉積物樣本,並搭配人骨進行比對。研究團隊使用鳥槍法與粒線體DNA靶向捕獲技術,成功從沉積物中辨識出人類粒線體單倍群。結果顯示,即使骨骼已腐朽,沉積物仍能保存可用的遺傳訊息,為缺乏人骨的考古遺址提供了新的研究途徑。

樣本解讀

站內統計顯示,這批樣本共4例,Y染色體全數未能解析,粒線體則以M7a1b1最常見(2例),另有D4j與D4a1各1例。M7a1b1與D4系列皆為東亞、特別是日本群島常見的粒線體單倍群,符合沖繩具宿時代與北海道薩門時代的時空背景。樣本數雖少,但已初步展現沉積物DNA在族群遺傳研究上的潛力。

對祖源愛好者的意義

對祖源愛好者而言,這代表未來即使沒有完整人骨,也能從墓葬或居址的土壤中取得母系遺傳線索。粒線體單倍群如M7a1b1、D4j、D4a1,可幫助追溯古代人群的遷徙與母系源流,讓露天遺址不再只是空白。

摘要

在勝連城遺址採集了五個沉積物樣本,該遺址位於沖繩,年代為12世紀中葉至13世紀初的城時代(圖1)。在此,城堡牆下發現了兩具帶有骨骼遺骸的墓葬。從第138號坑中採集了一個來自頭骨內部的沉積物樣本。從第178號坑中獲得了四個沉積物樣本:一個來自頭骨內部,一個來自髖骨周圍的沉積物,一個來自肋骨周圍的沉積物,以及一個來自坑外地區的樣本(圖1,表S1)。此外,從每個個體採集了一根肋骨,以與從沉積物中獲得的結果進行比較。第二個遺址是一個名為大島2的居住遺址,年代為11至12世紀的薩摩門時期,位於北海道(圖1)。我們從該遺址內的不同環境中採集了十一個沉積物樣本(圖S1,表S2)。從所有樣本中提取了DNA,並使用Illumina NovaSeq和iSeq平台進行測序(見方法)。我們進行了鳥槍法測序(讀取數介於12447839至85971229之間)和針對人類mtDNA的靶向捕獲富集(讀取數介於70064至2174014之間)的組合,以研究從露天考古遺址的沉積物樣本中確定人類mtDNA單倍群的可行性。

TheYtree 上的樣本與資料

4站內樣本
0Y 單倍群已解析

母系(mtDNA)單倍群