Genetic Evidence of Yersinia pestis from the First Pandemic

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約旦傑拉什萬人坑首度找到查士丁尼瘟疫的鼠疫菌DNA。

過去我們對第一次鼠疫大流行的基因認識，多半來自歐洲樣本，東地中海作為疫情最早記載的地區卻一直缺乏直接證據。這篇研究從約旦傑拉什一座六至七世紀的萬人坑中，用蛋白質體學初步篩查、再以古DNA定序，成功在五個個體身上找到鼠疫耶爾森菌的基因組。這是首次在接近歷史疫源地的區域取得基因證據，把考古現場與病原體基因直接連起來。

• 首次在東地中海、鄰近查士丁尼瘟疫歷史疫源地的約旦傑拉什，取得鼠疫耶爾森菌的古DNA基因組證據。
• 五個個體的鼠疫菌基因組幾乎完全相同，顯示當時當地流行的是單一譜系。
• 這些菌株與其他第一次鼠疫大流行譜系緊密聚類，支持其屬於同一波大流行。
• 研究結合蛋白質體學篩查與古DNA全基因組定序，建立古代病原體檢測流程。

樣本解讀

站內這批樣本共12例，其中11例可解析Y染色體單倍群，全部落在R系之下，包括R-L754、R-M269、R-P297、R-L2等，呈現以R1b為主的父系組成。母系僅1例有紀錄且標示為N/A，無法進一步判讀。整體樣本量小、母系資料幾乎空白，因此這批數據只能反映該遺址父系的多樣性一角，不宜過度推論族群全貌。

對祖源愛好者的意義

對祖源愛好者來說，這提醒我們：古DNA不只用來看人的遷徙，也能追蹤病原體的傳播。鼠疫這類傳染病曾深刻影響人口結構與家族延續，未來若把病原體資料與父系、母系譜系並讀，將更完整理解古代人群的命運。