全基因組資料也能準確推斷血型,但深度是關鍵。
這篇研究想測試:用全基因組定序資料,能不能準確判斷紅血球抗原與HLA型別?他們分析了79個人的全基因組資料,針對9種紅血球抗原與HLA-DRB1,並自建包含1648個變異位點的資料庫。結果顯示,血型多態性有93%與舊方法一致,HLA-DRB1則有91%一致。研究強調,定序深度要高於15倍才可靠,否則可能出錯或無法判讀。整體來說,全基因組定序做血型分型是可行的,但技術仍需優化。
站內樣本共79人,全部來自單一地點UZ8_90,且Y染色體單倍群全數成功解析。父系以R-M87為最大群(5人),其次為R-FT414862與R-FT412111(各4人),呈現多個R系分支。母系較分散,Z7與U2b2各3人最多,其餘如H、M30、HV2a、R5a2各2人。整體樣本數不多,但涵蓋多種父系與母系單倍群,適合用來初步觀察全基因組血型分型的可行性。
對祖源愛好者來說,這代表未來上傳全基因組資料時,除了尋根,還可能同時獲得血型與免疫基因資訊。但要注意定序深度是否足夠,否則結果可能不準。這也提醒我們,祖源檢測與醫療應用之間的界線正在模糊。
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| 單倍群 | 現代人 | |
|---|---|---|
| R-M87 | 5 | |
| R-FT414862 | 4 | |
| R-FT412111 | 4 | |
| R-FT414871 | 3 | |
| R-BY127338 | 3 | |
| R-FT414897 | 2 | |
| R-FT353743 | 2 | |
| R-FT414889 | 2 | |
| R-FT321740 | 2 | |
| R-FT414875 | 2 | |
| R-Y210678 | 2 | |
| R-FT414891 | 2 |