祖源树 登入 科研 古人 論文

A reference quality, fully annotated diploid genome from a Saudi individual

來自沙特個體的參考質量、完全註釋的二倍體基因組
PRJNA891101 原始論文 / DOI2024-11-231 樣本(研究)

AI 解讀AI 生成

沙特首个端粒到端粒个人基因组KSA001发布。

研究团队用多种测序方法,对一名沙特志愿者的基因组进行从头组装与完善,得到除Y染色体外所有染色体的连续组装,命名为KSA001。他们还把参考基因组的注释转移过来,完成全基因组注释,并依FAIR原则免费公开所有测序数据、组装和注释。这是首个来自沙特个体的端粒到端粒组装基因组,可供任何人免费使用。

樣本解讀

站内目前仅收录1例样本,Y染色体未解析,因此无法提供父系单倍群信息;母系仅见M30-C16234T一支,样本量极小,不能代表沙特人群整体母系构成。该样本来自沙特阿拉伯,属于西亚人群,但单例数据只能作为参考,不宜据此推断更广泛的祖源关系。

對祖源愛好者的意義

对祖源爱好者而言,KSA001提供了西亚人群的高质量参考基因组,未来可帮助比对和解读沙特及周边地区的祖源成分。但站内样本极少,当前母系线索仅供参考,仍需更多数据才能做可靠的人群分析。

摘要

我們使用了多種測序方法對來自沙烏地阿拉伯的一名志願者的基因組進行測序。我們使用所得數據生成基因組的從頭組裝,並使用不同的計算方法來完善組裝。因此,我們提供了來自沙烏地阿拉伯的一名個體的所有染色體(除 Y 染色體外)的完整基因組的連續組裝,並將此組裝標記為 KSA001。我們將基因組註釋從參考基因組轉移以對 KSA001 進行完整註釋,並使用 FAIR 數據原則將所有主要測序數據、組裝和基因組註釋免費提供給公共資料庫。KSA001 是第一個來自沙烏地個體的端粒到端粒組裝基因組,可免費用於任何目的。

TheYtree 上的樣本與資料

1站內樣本
0Y 單倍群已解析

母系(mtDNA)單倍群