Heterogeneous Hunter-Gatherer and Steppe-Related Ancestries in Late Neolithic and Bell Beaker Genomes from Present-Day France

从新石器时代晚期到青铜时代的过渡见证了西欧人口和社会的重要变迁。¹ 这些变迁包括来自黑海-里海草原的牧民^2,3对当地人口基因组的大量贡献，这是由于逐渐衰落的狩猎采集者和不断扩张的安纳托利亚裔农民之间复杂的互动所致。^{4, 5, 6, 7, 8} 这一过渡时期已通过来自当今英国^9,10、爱尔兰^11,12、伊比利亚半岛¹³、地中海岛屿^14,15和德国⁸的大量古代基因组数据得到证实。然而，在法国，这一过渡时期却在很大程度上被忽视了，法国的研究主要集中在中新石器时代（n = 63）^8,9,16，仅有一个新石器时代晚期基因组的测序覆盖度为0.05×。¹⁶ 这使得涵盖约公元前3400年至2700年的关键过渡时期被忽略。由于公元前3400年至1600年间（校准年份）的人类基因组样本缺乏遗传学研究，因此狩猎采集者持续存在的时间以及草原迁徙的确切时间范围尚不清楚。为了弥补这一空白，我们对来自法国的24个古代人类基因组进行了测序，时间跨度约为公元前3400年至1600年。测序结果显示，新石器时代晚期人群具有遗传多样性，其中包括肤色、头发和眼睛颜色较深的个体。我们在新石器时代晚期人群中检测到了异质性的狩猎采集者祖先成分，在某些个体中，这一比例高达约63.3%。此外，我们还发现，在钟形杯文化人群中，草原牧民的遗传贡献也存在差异。我们估计，新石器时代和中石器时代人群的基因混合最早可追溯到公元前3800年左右，而草原相关祖先的到来最早可追溯到公元前2650年左右。这些基因组异质性凸显了即使在局部范围内，人类互动历史的复杂性。